壹、領域不符合，企業所屬行業屬傳統及淘汰行業；
二、企業缺乏核心自主知識產權；
三、研發項目缺乏科學的設計和安排；
四、研發費用未按認定辦法的要求歸集，且比例難以達到認定要求；
五、高新產品或服務收入比例較低；
六、缺乏嚴格規範的研發體系和相應的組織管理安排等。
另外，很多企業由於是首次申報高新科技項目，對高新申報過程和材料編寫缺乏經驗，對政策了解不透徹等，也容易導致申報失敗。這時候，聘請專業的高新申報服務機構顯得非常必要。