1、法律地位不同：有營業執照的企業是經過國家認可的，有獨立的法人資格，可以獨立開展經濟活動、簽訂合同，有知識產權的企業並不是以知識產權為主營業務，其作為法律主體的地位並不會因為知識產權的擁有或缺乏而產生變化。
2、商業模式不同：有營業執照的企業主要從事各類市場交易活動，經營範圍廣泛，有知識產權的企業更多的是由智力資產構成。
3、維權方式不同：有營業執照的企業在面對經濟糾紛時，通過法院或仲裁機構途徑來解決問題，有知識產權的企業在遭遇知識產權侵權時，采取專利、商標法律手段來維護自己的權益。