雜交谷子制種技術性強。為了保護知識產權，目前，雜交谷子制種由河北張家口市農業科學院獨立完成。
雜交谷子制種就是將母本和父本以不同的行數相鄰種植在壹起，通過調整播期、父母本密度，並加以人工輔助授粉，讓母本盡可能多結實。母本收獲後，經過質量鑒定、清選、加工、包衣、灌裝等程序，加工出來的種子就是合格的雜交種。經過努力，目前雜交谷子制種產量已穩定在1500千克/公頃，制種田產量與生產田用種比為100∶1，技術成熟，達到產業化應用水平。