妳是要申請國家高新技術企業還是深圳高新技術企業？建議妳申請國家高新技術企業好。
不管認定哪家好，主要是看妳公司符不符合要求，申請的通過率大不大，是不是潛在的高新技術企業對象。
申請國家高新技術企業的條件：
（壹）企業申請認定時須註冊成立壹年以上；
（二）企業擁有核心知識產權，通過自主研發、受讓、受贈、並購等方式獲得，並對其主要產品（服務）
在技術上發揮核心支持作用；在中國境內註冊的企業，通過自主研發、受讓、受贈、並購等方式或5年以上的獨占許可方式，對其主要產品的核心技術擁有自主知識產權的所有權，且達到下列其中壹項數量要求：
A、發明或者植物新品種2件以上；
B、實用新型專利6件以上；
C、非簡單改變產品圖案和形狀的外觀設計專利或軟件著作權或者集成電路布圖設計專有權7件以上；
（三）發揮核心支持作用的技術屬於《國家重點支持的高新技術領域》規定的範圍；
（四）企業從事研發和相關技術創新活動的科技人員占企業當年職工總數的比例不低於10%；
（五）企業近三個會計年度（實際經營期不滿三年的按實際經營時間計算，下同）的研究開發費用總額占同期銷售收入總額的比例符合如下要求：
A、 最近壹年銷售收入小於5,000萬元（含）的企業，比例不低於5%；
B、最近壹年銷售收入在5,000萬元至2億元（含）的企業，比例不低於4%；
C、最近壹年銷售收入在2億元以上的企業，比例不低於3%；
其中，企業在中國境內發生的研究開發費用總額占全部研究開發費用總額的比例不低於60%；
（六）近壹年高新技術產品（服務）收入占企業同期總收入的比例不低於60%；
（七）企業創新能力評價應達到相應要求；
（八）企業申請認定前壹年內未發生重大安全、重大質量事故或嚴重環境違法行為。