院地合作處與中科院上海國家技術轉移中心及上海中科國嘉技術轉移有限公司“三位壹體”作為中國科學院上海高等研究院的重要職能機構，負責中科院上海高等研究院與地方合作，促進技術孵化與社會資源的融合，加快科學技術成果的轉化，開展孵化、轉移轉化、知識產權管理、高研院的經營性資產管理及融資、投資、對外合作商務策劃與管理等工作。
建設內容：
（1）技術轉移孵化平臺建設
設立孵化器，以及高研院各產業化基地中也有相應比例的孵化功能規劃，為技術的轉移轉化服務。
（2）產業化基地建設
基地將依托高研院的技術和人才資源優勢，利用地方的區位、資金和市場優勢，通過科技成果的產業化，促進區域產業集群的形成、技術集成。
（3）設立投資基金，促進項目和資本的無縫對接
高研院針對項目投資的早、中、後三個階段，設立高研院投資基金若幹個。
（4）加強團隊，提升專業化水平
采取“引進、培養人才，同聘請專家、顧問並舉”的人才建設戰略，逐步建立壹支有200人左右的技術轉移專業化團隊。
（5）強化知識產權管理，提升無形資產價值
加強知識產權管理，構建高研院知識產權管理體系。推廣和經營高研院的知識產權，同時管理、協調和保護高研院的知識產權。
發展路線：