辦公室 負責機關、所屬單位和全國及海外各團體會員的綜合協調工作；承擔協會重大活動、會議的安排和組織；負責機關文秘、檔案、行政管理、財務、機關人事、黨務、紀檢監察管理等工作。
會員工作部 負責會員的聯絡、組織、管理工作；負責發展會員，收繳會費；建立會員藝術檔案；維護會員的知識產權等合法權益；組織美術家采風、深入生活，對各創作中心進行聯絡與管理。
展覽部 承辦協會主辦的國展覽，負責展覽的策劃、組織、發動、實施等各項具體工作；主辦會員作品展覽及其它展覽。
對外聯絡部 綜合協調好和組織協會對外書法交流以及與香港特別行政區、澳門特別行政區和臺灣地區的藝術交流；負責組織畫家出訪，負責邀請和接待國外（境外）畫家的來訪，承辦協會的外事工作。
藝術委員會 為繁榮藝術創作，開展學術研究，中國青年美術家協會成立藝術委員會。藝術委員會為學術性咨詢機構，其主要任務是：研究當前創作中的重大問題，研究協調、審批各專業藝術委員會的活動安排以及審定活動經費等重大事項。 藝術委員會下設各專業藝術委員會。其主要任務是：組織本專業的全國及海外會員，進行藝術創作，開展學術研究，舉辦作品觀摩展覽，制定本專業藝術委員會的活動計劃。 現成立的專業藝術委員會有： 中國青年美協中國畫藝術委員會 中國青年美協油畫藝術委員會 中國青年美協版畫藝術委員會 中國青年美協雕塑藝術委員會 中國青年美協水彩畫藝術委員會 中國青年美協漆畫藝術委員會 中國青年美協壁畫藝術委員會 中國青年書協陶瓷藝術委員會 中國青年美協插畫裝幀藝術委員會 中國青年美協連環畫藝術委員會 中國青年美協漫畫藝術委員會 中國青年美協理論委員會 中國青年美協工業設計藝術委員會 中國青年美協藝術委員會 中國青年美協平面設計藝術委員會
研究部 負責研究藝術創作動向；組織美術理論研究、學術交流和培訓活動；負責協會重要文件的起草；負責重大展事的組織和評選活動；對各培訓中心進行聯絡和管理。
培訓中心 為開展高級繪畫藝術專業人才的培訓工作，加強會員的藝術修養、提高會員的創作水平。