壹、類型不同：
1、臨時登記——經田間小區試驗後，需要進行田間示範試驗、試銷的肥料產品，生產者應當申請臨時登記。
2、正式登記——在獲得臨時登記後，經田間示範試驗、試銷可以作為正式商品流通的肥料產品，生產者應當申請正式登記。
二、有效期不同：
1、肥料臨時登記證有效期為壹年。肥料臨時登記證有效期滿，需要繼續生產、銷售該產品的，應當在有效期滿兩個月前提出續展登記申請，符合條件的經農業部批準續展登記。續展有效期為壹年。續展臨時登記最多不能超過兩次。
2、肥料正式登記證有效期為五年。肥料正式登記證有效期滿，需要繼續生產、銷售該產品的，應當在有效期滿六個月前提出續展登記申請，符合條件的經農業部批準續展登記。續展有效期為五年。登記證有效期滿沒有提出續展登記申請的，視為自動撤銷登記。登記證有效期滿後提出續展登記申請的，應重新辦理登記。
三、登記申請要求：
1、生產者申請肥料臨時登記前，須在中國境內進行規範的田間試驗。
2、生產者申請肥料正式登記前，須在中國境內進行規範的田間示範試驗。對有國家標準或行業標準，或肥料登記評審委員會建議經農業部認定的產品類型，可相應減免田間試驗和/或田間示範試驗。
擴展資料
《肥料登記管理辦法》第十三條有下列情形的肥料產品，登記申請不予受理：
(壹)沒有生產國使用證明(登記註冊)的國外產品；
(二)不符合國家產業政策的產品；
(三)知識產權有爭議的產品；
(四)不符合國家有關安全、衛生、環保等國家或行業標準要求的產品。
第十四條 對經農田長期使用，有國家或行業標準的下列產品免予登記：
硫酸銨，尿素，硝酸銨，氰氨化鈣，磷酸銨(磷酸壹銨、二銨)，硝酸磷肥，過磷酸鈣，氯化鉀，硫酸鉀，硝酸鉀，氯化銨，碳酸氫銨，鈣鎂磷肥，磷酸二氫鉀，單壹微量元素肥，高濃度復合肥。
百度百科-免於登記肥料
中華人民***和國農業部-肥料登記資料要求