法律分析：申請前需要準備的材料：
1、主體材料：國內企業需要在工商部門註冊，具有法人資格的公司；沒有禁止申請的情形（包括產業政策、知識產權等方面）。
2、申請書：包括《肥料產品登記清單》和《登記申請書》；
3、安全有效性材料：包括產品安全性資料、產品有效性資料和田間試驗報告；產品執行標準、產品樣品等；
4、產品基本信息：包括生產企業的基本資料，產品研發報告、肥料樣品、生產工藝資料。
如何辦理肥料登記證
1、向省級農業廳提交申請。將上述材料準備好後，在省農業廳辦理窗口上報申請。省農業廳對材料和實體進行初審，符合規定的作出同意的意見，加蓋公章。
農業部行政大廳上報材料。省級初審通過後，申請人要將材料上報農業部行政審批大廳，大廳工作人員將對提交的材料進行復審。根據材料的情況分別作出受理、不予受理和補充材料的決定。
2、秘書處核驗樣品。在大廳審核材料的同時，申請人要將肥料樣品提交農業部肥料評審委員會秘書處核驗。在大廳材料審核通過，秘書處樣品核驗都通過的情況下，作出正式受理決定。
3、肥料評審委員會檢測。正式受理後，肥料評審委員秘書處將會組織專家，對肥料的安全性、有效性進行綜合的檢測。這段時間可能比較長，在九個月之內可以出具結論報告。
4、批準程序。肥料評審委員會作出測評報告，認定生產的肥料具有安全性和有效性，達到國家規定的標準時，將出具報告。農業部根據報告的內容和前期審查的材料，作出審批建議，報農業部審批。如果符合條件的，審核通過辦法肥料登記證。
法律依據：《肥料登記管理辦法》 第六條 肥料登記分為臨時登記和正式登記兩個階段：
（壹）臨時登記：經田間試驗後，需要進行田間示範試驗、試銷的肥料產品，生產者應當申請臨時登記。
（二）正式登記：經田間示範試驗、試銷可以作為正式商品流通的肥料產品，生產者應當申請正式登記。