《知識產權法哲學》（馮曉青著，中國人民公安大學出版社2003年版，31萬字）壹書對知識產權法的基本制度、原則和規範蘊含的法理從哲學高度進行了探討，對知識產權法的基本目標和價值進行了哲學分析，為知識產權法提供了比較系統的理論基礎。其理論創新體現於為知識產權法研究與學科建設提供新的理論思路與觀點、基本的理論分析框架和實用的方法論原則等方面。該書作為國內知識產權法哲學方面的第壹部理論專著，以知識產權法的哲學理性為切入點，試圖提出知識產權法哲學的理論框架體系，在法哲學視野下對知識產權與知識產權制度的基本問題做出合理的解釋和分析。
《企業知識產權戰略》（馮曉青著，知識產權出版社，2001年第1版，30萬字；2005年第2版，48萬字；2008年第3版，79萬字；2014年第4版，50萬字）屬於知識產權法應用研究成果，系國內首部系統研究企業知識產權戰略學術專著。該書開辟了我國知識產權保護之應用研究新天地，使知識產權法學學科找到了壹個十分重要的應用領域。該書出版後即受到學術界和實務界的高度評價，成為我國知識產權保護應用領域的重要著作和權威之作。該書出版後迄今為止已重印10余次、再版3次，在法學和管理學等領域被廣泛推廣使用。
《知識產權法利益平衡理論》（馮曉青著，中國政法大學出版社2006年版，98.5萬字）全書***分六編，計三十三章。第壹篇導論闡述知識產權法利益平衡的基礎理論與基本原理；第二編研究知識產權法的目的與利益平衡，涉及知識產權法目的與利益平衡的壹般關系、知識產權各專門法的立法宗旨與利益平衡；第三編探討知識產權的私權保護及其擴張，通過大量史實和理論探討，揭示了知識產權制度發展內在的動態平衡；第四編分析知識產權法中的公***利益，論述知識產權法通過保護私權以激勵創造、促進社會財富的增長，體現出重要的公***利益；第五編剖析知識產權人利益與公***利益之間的平衡，根據知識產品的信息特征分析知識產權法的利益平衡機制，以及知識產權各專門法中私人利益與公***利益平衡的模式；第六編探討了實現知識產權法利益平衡的主要制度設計。
《知識產權專題判解與學理研究叢書》（12冊，每冊均為馮曉青主編，中國大百科全書出版社2010年版，總字數約800萬字）按照知識產權法的基本理論進行類型化研究，不僅改變了個案研究格局，而且在類型化、專題化研究中，結合案例綜合研究而提出了許多新的見解、觀點和思路。最高人民法院知識產權審判庭原庭長蔣誌培撰文指出：“叢書的出版標誌著我國知識產權訴訟實務研究的重要進展”，“對於推動我國知識產權審判理論研究，提升知識產權訴訟實務水平均具有理論價值、實踐操作意義和廣闊的應用前景”《中國知識產權報》2010年5月21日）。
《企業知識產權管理》（馮曉青著，中國政法大學出版社2012年版，44萬字）壹書以管理學和知識產權法原理為指導，對企業知識產權管理基本理論、企業知識產權管理體系、企業知識產權管理策略、企業技術創新與知識產權管理、企業知識產權戰略管理以及企業知識產權管理保障體系等問題進行了全面而深入的研究，闡明了企業知識產權管理在當代企業管理中的重要地位和作用，對我國企業強化知識管理創新工作，提高知識產權管理水平具有重大的理論指導作用與實踐操作價值。
《技術創新與企業知識產權戰略》（馮曉青著，知識產權出版社2014年版，55萬字）壹書系馮曉青教授主持的2008年度國家社會科學基金項目結項成果。