認定機構收到企業申報材料後，從專家庫中抽取至少5名評審專家(其中技術專家不少於60%，並至少有1名財務專家) 組成專家組。審查內容主要包括以下三個方面：
1、合規性審查
審查企業的研究開發活動（項目）、年度財務會計報告和專項審計報告等是否符合《管理辦法》和《工作指引》的要求；
2、獨立評價
每名技術專家單獨填寫《高新技術企業認定技術專家評價表》，主要對企業知識產權、研究開發活動、主營業務、成果轉化及高新技術產品（服務）等情況進行評價打分；每名財務專家單獨填寫 《高新技術企業認定財務專家評價表》，參照中介機構提交的專項報告、企業的財務會計報告和納稅申報表等進行評價打分；
3、綜合評價
在各評審專家獨立評價的基礎上，專家組長匯總各位專家分數，按分數平均值填寫《高新技術企業認定專家組綜合評價表》。
註：具備條件的地區可進行網絡評審。
專家庫及專家選取辦法
（1）認定機構應建立專家庫（包括技術專家和財務專家），實行專家聘任制和動態管理，備選專家應不少於評審專家的3倍；
（2）技術專家應具有高級技術職稱，並具有《技術領域》內相關專業背景和實踐經驗，對該技術領域的發展及市場狀況有較全面的了解；財務專家應具有相關高級技術職稱，或從事相關工作10年以上並具備相關職業資格；
（3）認定機構根據企業主營產品（服務）的核心技術所屬技術領域從專家庫中隨機抽取專家組成專家組，並指定1名技術專家擔任專家組組長 ，開展認定評
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