壹、培養要求不同。
工學碩士：統招工科類研究生，側重於基礎理論學習和學術研究。
理學碩士：專攻理科方向（如數學、物理、力學、化學、生物學、天文學、地學等專業）的碩士研究生。
二、所屬科別不同。
工學碩士：工學碩士招收的是工科類專業的本科生。
理學碩士：理學碩士招收的是理科類專業的本科生。
擴展資料：
工學碩士的專業學位與學術型學位處於同壹層次，培養規格各有側重，在培養目標上有明顯差異。
學術型學位按學科設立，其以學術研究為導向，偏重理論和研究，培養大學教師和科研機構的研究人員。
而專業學位以專業實踐為導向，重視實踐和應用，培養在專業和專門技術上受到正規的、高水平訓練的高層次人才。
專業學位教育的突出特點是學術型與職業性緊密結合，獲得專業學位的人，主要不是從事學術研究，而是從事具有明顯職業背景的工作，如工程師、醫師、教師、律師、會計師等。
專業學位與學術型學位在培養目標上各自有明確的定位，因此，在教學方法、教學內容、授予學位的標準和要求等方面均有所不同。
參考資料：
百度百科-理學碩士
百度百科-工學碩士