截至2014年5月，該校建有合肥學院水環境治理及汙染控制院士專家工作站，合蕪蚌自主創新平臺“合肥環境工程研究院”，省級工程技術研究中心“固體廢棄物能源化利用工程技術研究中心”，安徽省建築節能技術平臺，省教育廳高校人文社會科學重點研究基地“環巢湖文化與經濟社會發展研究中心”等研究機構。
2012年，德國物流協會在該校設立了合肥分會。建有“深裝合大工業設計有限公司”、“安徽合大環境檢測有限公司”、“合肥學院—新方舟創意工場”等壹批校企***建的“嵌入式”實驗室 。
同時還設有房地產研究所、合肥環境工程研究院、中小企業發展研究中心、應用化工研究所、旅遊咨詢與規劃研究所、知識產權研究所、現代管理研究所、江淮文化研究所、土木工程管理研究所、發酵工程研究所、中德過程—新能源技術研究所、基礎教育研究所、外國文化研究所、大學生思想政治教育研究中心、中德合作環境技術轉化中心、藝術設計研究所等研究所（中心） 。
截至2014年5月，該校圖書館藏有印刷型圖書101萬冊；電子圖書69萬種（冊）；購置中國學術期刊全文數據庫、中國博碩學位論文全文數據庫、中文科技期刊數據庫、國研網、EBSCO數據庫、Springer Link 數據庫、視頻數據庫等國內外數據庫23個；自建數據庫7個，其中特色數據庫3個。
該校圖書館還與中國高校人文社會科學文獻中心（CASHL）合作，為校內讀者提供外文期刊、圖書文獻的原文傳遞。同時積極加入中國高等教育文獻保障系統（CALIS）和安徽省高校數字圖書館，通過文獻傳遞與館際互借為讀者獲取所需文獻 。 黨委書記：蔡敬民
黨委副書記、院長：張文兵
黨委委員、副院長：鄭永紅、陳嘯、丁明
黨委委員、紀委書記：洪家友
副院長：陳秀 楊承宗（合肥聯合大學首任校長）（原中國科學技術大學副校長，著名科學家，中國放射性化學奠基人）（1980.10.11~ 2011.5.27 ）
鄭 銳（合肥聯合大學首任董事長）（原中***合肥市委書記、合肥市人大主任）
王季琨（合肥聯合大學）（著名學者）
鄒淦泉（合肥聯合大學）（清華大學安徽校友會會長，原中***合肥市委書記、合肥市人大主任）
趙良慶（合肥學院首任校長）(2003.10~2009.03)
蔡敬民（合肥學院校長）（2009.07-2013.11）