技術開發合同能做合同備案。免稅。
技術開發合同申請免稅流程：
1、去公司所在的區科委領取技術開發合同的標準樣本，或者去技術市場管理辦公室的網站下載
2、根據雙方已經訂立的合同為依據填寫標準樣本合同並雙方簽字和蓋章（若雙方訂立的合同是英文需要專門翻譯機構翻譯成中文後加蓋翻譯章）
3、遞交填寫好的樣本合同同時把雙方訂立的原始合同作為附件
4、大約五個工作日左右會得到科委的批復，若通過認證，則取得壹張技術開發合同的登記證明
5、將得到科委認證的合同和登記證明遞交到上海市技術市場管理辦公室
6、十天左右可以得到批復，若通過，則在合同上會印有“xx市技術市場管理辦公室的合同認定章”
7、此時已經證明此合同屬於技術開發合同，可以去相關稅務部門申請免營業稅
8、去稅務局購買印花稅（總金額的萬分之三）貼在合同規定處
9、去專管員處領取申請免稅的清單和資料（可以免除5%的營業稅和相應的附加稅）提交申請後十天左右即可得到稅務局的最終批復（此過程中材料相對簡單）
10、當得到最終認定免稅的通知後，即可開具發票給客戶，並在當月申報過程中填寫免稅金額，以抵消稅款。
擴展資料：
技術開發合同是指當事人之間就新技術、新工藝和新工藝的新材料及其系統的研究開發所訂立的合同。
技術開發合同是指當事人之間就新技術、新產品、新工藝或者新材料及其系統的研究開發所訂立的合同，包括委托開發合同和合作開發合同。其客體是尚不存在的有待開發的技術成果，其風險由當事人***同承擔。
合同備案是指加工貿易企業持合法的加工貿易合同到主管海關備案、申請保稅並領取加工貿易《登記手冊》或其他準予合同備案憑證的行為。
技術開發合同是雙務有償合同，合同履行具有協作性。技術開發合同的風險由雙方***同負擔。
參考資料：