中華民國十八年（1929年）7月1日，劍閣縣知事公署改稱劍閣縣政府，縣政府下設教育局，稱為劍閣縣政府教育局。
民國三十五年（1946年）6月1日，劍閣縣政府調整直屬機構，設三室八科，劍閣縣政府教育局改為劍閣縣政府教育科。
中華人民***和國成立後，1949年12月18日劍閣縣人民政府成立，次年1月，原劍閣縣政府教育科正式改為劍閣縣人民政府教育局。
1955年劍閣縣人民政府改稱劍閣縣人民委員會，劍閣縣人民政府教育局更名為劍閣縣教育局。
後改為劍閣縣文化教育局（簡稱劍閣縣文教局），20世紀80年代改為劍閣縣教育委員會（簡稱劍閣縣教委），90年代末復改為劍閣縣教育局。
2003年9月劍閣縣人民政府駐地由普安鎮遷址下寺鎮後，翌年，劍閣縣教育局遷往新縣城下寺鎮辦公。
2011年，根據《劍閣縣人民政府機構改革方案》，劍閣縣教育局與劍閣縣科學技術局合並組建劍閣縣教育和科學技術局，掛劍閣縣知識產權局牌子。
2015年初，根據中***劍閣縣委員會、劍閣縣人民政府《劍閣縣人民政府職能轉變和機構改革方案》（劍委〔2015〕7號），原劍閣縣教育和科學技術局負責的科學技術管理等職責劃歸重組後的劍閣縣經濟商務和科技信息化局，劍閣縣教育和科學技術局重新改組更名為劍閣縣教育局。 劍閣縣教育主管部門歷史簡表歷史時期時間教育主管單位名稱隸屬駐地民國時期1929年7月—1946年6月劍閣縣政府教育局劍閣縣政府普安鎮 1946年6月—1950年1月劍閣縣政府教育科劍閣縣政府普安鎮新中國時期1950年1月—1955年劍閣縣人民政府教育局劍閣縣人民政府城關鎮1955年—？劍閣縣教育局 劍閣縣人民委員會城關鎮？—20世紀80年代劍閣縣文化教育局 劍閣縣革命委員會城關鎮20世紀80年代-90年代劍閣縣教育委員會劍閣縣人民政府普安鎮1955年—2011年劍閣縣教育局劍閣縣人民政府 普安鎮
下寺鎮 2011年—2015年1月劍閣縣教育和科學技術局劍閣縣人民政府下寺鎮2015年1月—至今劍閣縣教育局劍閣縣人民政府下寺鎮