1．轉基因技術的安全問題
農業轉基因技術是當今世界最熱門也是發展最快的研究領域之壹，他為人類提供了大量的轉基因食品，全世界轉基因作物的種植面積已由1996年的170萬公頃擴大到2001年底的5000公頃，現在食用轉基因食品的人至少已有10億之多。轉基因技術因與人類生活密切相關而深受世人關註。壹些國家出臺政策對農業轉基因技術的開發和應用積極扶持，也有壹些國家特別是歐洲的壹些國家對轉基因食品存有疑慮和恐慌，紛紛要求對轉基因食品的銷售采取限制措施。轉基因技術是在基因水平上進行操作，改變已有的基因，改良甚至創造新的物種。DNA是生命的藍圖，基因壹旦被改動，可能引起生物體內壹系列未知的結構與功能的變化，而這種變化又會通過遺傳傳遞，產生無數拷貝並代代相傳。如果轉基因技術應用不當，壹旦產生不良後果，其危害會不斷擴展和傳遞。例如，人們普遍關心外源基因引入生物體特別是引入人體後，是否會影響其他重要的調節基因，甚至會激活原癌基因，轉基因技術的廣泛應用是否會導致難以消滅的新病原物的出現，是否會造成生態學災難，人類攝食大量轉基因食品是否會影響人類及其後代的健康。這些問題目前還難以用確切的實驗證據來做出明確的答復，因為某些影響和作用目前還難以檢測，或者還需要經過對幾代人的分析後才能下結論。
面對沸沸揚揚的輿論，為減少消費者的擔心，很多國家采取或擬采取標識制度，讓轉基因食品亮出身份，把選擇的權力交給消費者。我國的壹些科學家認為，對轉基因食品的恐慌是沒有科學根據的，迄今為止還沒有壹個例子證明轉基因作物有毒，農業轉基因技術是福不是禍。當然轉基因農業畢竟是前所未有的事業，由於事關廣大人民群眾的食品安全，我國政府采取了很審慎的態度。2001年國務院頒布了《農業轉基因生物安全管理條例》，建立了對農業轉基因生物的安全評價制度和標識制度。
人們當然也關心生物技術引發的社會問題。科技先進、研究經費充足的國家，就可能首先獲得壹些涉及人類生存與發展的重要生物技術，而對這些技術實行壟斷應用，特別是將生物技術應用於武器制造和戰爭，其後果將不堪設想。對人類可能將是壹場比原子彈爆炸更為可怕和持久的災難。有人曾設想利用不同種族的人在遺傳基因上的特異性，設計壹種生物技術武器，可以傷害壹個民族的人，而對同樣環境條件下的其他民族的人毫無威脅。在這個民族矛盾仍很普遍的人類社會，這種武器可助紂為虐。另外，宗教界與生物保護組織提出種種理由反對轉基因技術應用也引發了另壹方面的社會問題。
2．人類生存環境的異化
人類是地球長期自然進化的產物，而由於人的智力的進化以及科學技術在近代以後的快速發展，人產生了幹預進化過程的能力。生物技術就可以徹底改變人們的生活和進化方向，生物技術不但可以使人類自身異化，也可以使人類的生存環境異化。過去人類是通過適應自然而生存，而今天和未來，領先基因技術可以創造"超人"，人可以"四兩搏千斤"，讓自然適應人類。因而生物技術可以主導人類的進化方向並引發激烈和徹底的社會革命。人與其它物種的生存競爭完全不在壹個層次上。人類還可以改變環境甚至改變自身，對人類的各種自然選擇壓力都已被征服了，人類不必再通過自然選擇來被動地適應環境，人類現代的進化越來越多地受到人為的、來自科學技術的幹預。人類目前的行為極大地改變著未來的物種進化過程。讓很多科學家感到憂慮的是，在現代醫學發展的同時，許多對人類產生死亡威脅的基因保存了下來。壹方面，醫學科學發展以及環境改善的同時，人類喪失了對壹些傳染病的抵抗力；另壹方面，現在細菌和病毒幾乎已經學會了如何對付所有的藥物，誰也不知道基因改造會給有機物帶來什麽後果。
生物工程的發展可能給我們這樣壹個世界：物種會極豐富，而且有很多不是自然界進化的產物，也不是上帝創造的，而是人造的。現在已出現了"工程生物"的概念，工程生物是生物技術的產物，是人造的生物，其中會有壹些並非人有意制造的，而是某種生產過程的"副產品"。工程生物將快速增加，可能有壹天人成為真正的造物主。大量的工程生物對人類來說意味著什麽？這是壹個事關人類前途命運的問題。地球上物種的人為遷移也給人類造成不可收拾的局面，"生物入侵"成為壹個新的令人頭疼的問題。我國政府就已宣布微柑橘、紫莖則蘭等為"不受歡迎的外來物種"。
地球在過去200年間發生的變化比過去2000年還要大，而過去20年間的變化則超過了過去的200年。歷史上人類確實曾為自身的進化"買單付賬"，但會不會有壹天我們再也付不起那份沈重的賬單？
3．克隆人的倫理問題
生命科學與人自身及人類社會的聯系比其他任何自然學科都更加緊密，它關系到每壹個人的命運，所以由此引發的爭論當然也最激烈。克隆人引發的爭論有技術上的，也有社會倫理方面的。其焦點問題還在於它帶來了某些潛在的威脅和社會倫理方面的問題。
克隆技術壹旦用於人類自身，人類新成員就可以被人為地創造，成為實驗室中的高科技產物，他們不是來自合乎法律與道德標準的傳統的家庭，兄弟、姐妹、父母、子女之間的相互人倫關系必將發生混亂。人們很難想象和接受這種對人類社會基本組織——家庭的巨大沖擊。這對人類社會現有法律、倫理、道德產生威脅，對人類的觀念是嚴峻的挑戰。
4．基因治療的權限問題
生物技術的深入發展促進了醫療技術的提高。隨著在分子水平上對遺傳疾病致病機理的深入研究，基因治療技術今後還將有更深入的發展和更廣泛的應用。最終可以用分子生物學技術對變異基因進行修正。那麽，基因治療應該在什麽範圍之內進行？誰有權對基因治療"拍板"？
到目前為止所實施的所有基因治療病例都以病人的體細胞為轉基因的受體或靶細胞，這種體細胞基因治療只影響治療對象，這種操作需得到知情的患者同意。但如果把基因治療引入胚胎細胞或生殖細胞，這種操作則涉及到後代（未出生嬰兒）基因結構的改變。雖然有可能徹底治療某種遺傳疾病，但這壹改變將直接影響下壹代甚至下幾代。面對"定制嬰兒"的美好理想，人們不禁要問，父母有權挑選下壹代的相貌體征甚至人格特征嗎？壹個人有權決定另壹個人的基因結構或未來命運嗎？更嚴重的是，萬壹這種基因操作失敗了或者造成了將來才能發現的不可挽回的缺陷和後果，誰來承當責任？
如果基因診斷的方法真能讓每個人在幼年時代便知道自己今後可能會患上某種重病，有人覺得這也是壹件很不美好的事情，覺得這太過殘酷和宿命了。
還有人擔心如果某種可以增強人的體能特征的基因被確定和被克隆下來，通過基因治療的操作來增加人的體能，比如增加運動員的身高或短跑速度，這與運動員服用興奮劑有什麽本質區別？由於可能影響到人類及其個體成員的命運，所以不同的意見和觀點仍然在激烈地爭論著。
5．個人基因信息的隱私權問題
個人基因信息的隱私權是壹個很現實的問題，由人把它成為"後基因組時代的人權問題"。人類基因組計劃的加速完成，使我們能夠測定每個人的基因數據，能夠鑒定或預測越來越多的與疾病相關的基因並設法治療這些遺傳疾病，但另壹方面，誰有權負責保管個人的基因信息資料？如何有效保護個人的基因信息資料？公民個人的基因數據經過科學家測試、研究、開發可以加以利用，這壹成果應屬於誰？權益如何劃分？利益如何分享？"個人數據"是否會被濫用？另外，有基因缺陷或差異的人在社會活動中是否能受到真正平等和公正的對待？將來會不會像過去人們歧視某個人種那樣歧視某種基因？提出這些問題是因為個人基因信息的泄露可能會得到不正確的解釋或推測，也必然會影響壹個人的升學、求職、婚姻、人壽保險費用與醫療保險費用及其他待遇等壹系列的問題。
在人類基因組計劃建立之初，科學家們就十分關註基因組信息如何被正確地應用和個人與社會的利益如何有效地被保護等問題。為此，作為人類基因組計劃的壹部分，還特別設立了人類基因信息利用的倫理、法律和社會影響計劃（ELSI），以防止那些試圖搞種族歧視或個人歧視，甚至試圖實施種族侵略與滅絕暴行的人在人類基因組中找借口。
6．基因組資源及其管理問題
人類基因只有壹套，即人類只有壹個基因組，它包含的基因是有限的，所以人類基因組是有限的資源。基因科技在壹定程度上決定人類的未來生活，所以全世界都在關註人類基因組計劃，各國政府不惜代價，集團企業積極參與。據估計，至今為止，全世界各公司投入基因組研究的經費已達每年數十億美元，已超過了政府的投入。中國擁有22%以上的人口，有56個民族和許多遺傳隔離群，他們在遺傳上均有其特點，故中國是基因資源的大國，因而也成為"多國部隊"眼中的"基因新大陸"。各國都在競相搜集基因樣本，以爭奪知識產權。我國政府也已認識到基因的"資源"屬性，認識到基因資源的商業價值。我國科學家也在積極推進"國家生物資源基因組"計劃，希望盡可能地對中國絕大多數有經濟價值和科學價值的生物進行測序。
生命科學的快速發展給人們以極大的鼓舞與希望，但在面對希望的同時，我們也不得不面對發展中的代價，這引發了人們對技術本身的思考。
第壹，技術本身兩面性。
技術本身就是壹把雙刃劍，再善良的人來應用科學技術，也不會只有陽光。特別是技術的應用是壹個探索過程，技術的負面效應往往是在探索過程中逐漸表現出來，像滅蟲藥DDT就是先被捧後被殺的。例如轉基因農業是前所未有的事業，轉基因是品畢竟是把壹種外源的基因轉移到某種生物體當中，作物由於人為的、技術的原因發生的變異到底對人的身體和環境有什麽影響，是需要生物學家認真研究的。
基因技術的兩重性還表現在為人類服務的同時也帶來了壹些意想不到的社會問題。越是全新的、前所未有的技術，人類社會對它的法律、倫理的方面的準備越是顯得不足。面對壹下子出現的這些始料未及的問題，人類確實無所適從。
第二，技術目的性決定技術發展的方向。
技術是由掌握它的人來運用的，當技術應用於社會時就會體現人的目的性。不同的技術價值觀會產生不同的社會效果，別有用心的人還可能利用技術來危害社會，危害人類，此時技術手段便充當了壹個不光彩的角色。很多技術成果本來是為人類造福的，但由於其潛在的用途中包含對人和人類社會的威脅，還是令人憂心忡忡。2002年7月，美國壹個研究小組在實驗室中合成出第壹個小兒麻痹癥病毒。重建細菌的方法甚至更簡單。人造病毒可以幫助科學家對動植物進行基因改造，並幫助醫生治療某些疾病。但令人擔心的是，這種技術如果遭到濫用，比如用來制造生化武器，其結果將難以預料。更何況有些技術特別是武器技術，研制時的目的就很明確，就是要傷害人的。
不論從生物技術本身的急速膨脹，還是從人類對生物技術的不當利用來看，有人擔心未來可能出現"生物恐怖主義"是有壹定理由的。
所以，科學技術是美好的，但人的掌握和使用可以決定科學技術的命運，也可以影響全人類的前途命運。科學技術可以造福人類，也可以禍害人類甚至毀滅人類。人類要掌握好自己的前途命運，必須先掌握好自己手中的科學技術，為科學技術的航程掌好舵。
第三，對倫理問題的討論並非杞人憂天。
有的科學家有這樣的論點：凡是科學技術上能夠做的，就應該去做。現在，這壹"技術至上"的觀點已受到普遍質疑。
目前不少科學家還是懷有壹種理性的態度。如果由於擔心目前尚未成為現實的克隆人可能引發嚴重的倫理問題而禁止克隆技術，那就是因噎廢食，大錯特錯了。目前西方反科技的思潮認為科學技術的本性就是壞的、惡的，當代的許多問題都是科學技術造成的。因此對克隆技術容易產生偏見，對此我們應保持清醒的頭腦。但現代科學技術是如此發達如此強大，它所可能引發的負面效應又是如此明顯如此嚴重。這就促使人們不能不思考科學技術如何更好地為人類服務的問題，從而呼喚倫理的規範和引導。這是為了科學技術更健康有序地發展，更好地造福人類。
有人用蒸汽力技術和電力技術的例子說明我們人類在新技術面前總能"自動"過關，甚至有人說"周口店人可能也討論過能否被火燒死，但最後不是也過來了嗎？"對於這樣壹種論證方式，需要註意的是：科學技術和人類文明的發展都不是線性的，今天的很多技術手段的負面效應是不可逆轉的，有的甚至對人類具有毀滅性，不給人類"從頭再來"的機會。當代的科學技術與從前的科學技術不可同日而語。在小羊多利誕生後不久，克林頓宣布禁止用聯邦經費克隆人時說，"科學往往在我們懂得其含義之前就快速前進了。因此，我們有責任小心翼翼。"當代科學技術需要倫理的規範。這並非杞人憂天。科學上邁出的壹小步，可能是人類發展的壹大步。這壹大步邁向何方，須三思而行。