第二，政府在成果轉化的不同階段扮演不同的角色。從基礎研究到應用的轉化是我國當前創新體系中的薄弱環節，也是政府支持的重點。在應用研究階段，政府著眼於彌補市場失靈，通過公共資源的配置，發揮戰略和引導作用，帶動社會投資。在技術轉移階段，鼓勵企業進行商業化開發，完善知識產權保護，建立良好的成果轉移和後續監管機制，將創新轉化為效益。
第三，加強公立科研機構的社會公益性。公立科研機構轉化科研成果的最終目的是提高國民健康水平，彌補經濟發展的瓶頸，與企業的營利目的不同。NIH支持罕見疾病的研究，幫助弱勢群體；不為促進技術擴散的儀器發明申請專利；向中小型企業和新成立的企業提供技術轉讓補貼，以創造公平的競爭環境；對青年科學家給予特殊支持，提高醫學研究的人才梯隊。
第四，完善競爭機制，提高科研成果轉化效率。NIH各個環節的機制設計盡量鼓勵競爭，提高效率。申請項目時，信息充分公開，廣泛鼓勵科研人員申請。項目嚴格控制兩級評審制，根據項目特點采取資助、合作研發、設備享受、技術購買等靈活的資助方式。專利許可時，盡可能將同壹技術轉移給多家企業，形成錦標賽機制，激勵企業加速產業化應用。