商標註冊的申請主體人，必須是持有營業執照的個體商戶，或是公司，具有基本的商標註冊資格；而專利申請，即沒有年齡上的限制，也沒有職位和性別上的限制。只要個人具有新意的創造或想法，並將它付諸於了實踐，能產生價值的同時還能運用於工業生產之中，都可以將這項發明申請授權成為專利。它們的區別之壹，就是申請的主體人不同。
區別二：受理的部門以及授權流程上的差別
雖然無論是商標，或是專利都需要經歷、檢索、近似查詢、審核、授權等這些步驟，但是它們的受理部門，以及過程中審核的細節可謂是天差地遠。商標註冊受理的是商標局，而專利申請受理的是專利局，或是國家知識產權局。將商標註冊和專利申請混為壹談的人，多數都是沒能理解到它們的真正含義是什麽。
區別三：授權後期運用的方式以及地方都不同
商標獲得授權後，主要是對所屬公司的品牌形成保護作用，例如‘六個核桃’與‘木個核桃’之間，前者是正規的商業商品和品牌，後者卻是仿造前者投入市場使用的。因此這個時候，公司註冊的商標就是發揮法律效力作用的時候了。而專利通常有三種類型，多數更加註重功能、外觀以及它的獨創新穎技術，帶來的突破等。長運用於產生的生產、包裝以及外在宣傳上，在起到保護作用的同時，還能對競爭對手形成打壓和阻礙的作用。
區別四：授權所需的時間長，存在極大差異
就註冊商標而言，目前所需要時間是在6到10個月左右，而且申請過程相當繁瑣和復雜，對於新人來說，想要壹次性申請成功，幾乎就是不可能的。同樣，專利申請中包含有發明、實用新型以及外觀設計專利。後兩者申請時間在普遍在十個月左右，前者則是在2到3年左右。申請的難度，也是隨著類型的不同而相互變化。