使用該系統時，應特別註意以下事項:
1.補繳信息必須真實、完整、準確，尤其是銀行或郵局的匯款人填寫的匯款人、匯款賬號、銀行賬號、票據號、匯款金額等信息必須與實際匯款(銀行或郵局的收款信息)壹致，否則補繳信息無法與實際匯款信息匹配，導致銀行直接退款或郵局退款。
2.不同的專利類型有不同的申請號驗證規則和費用，只能單獨生成補充付費信息。因此，在補充不同類型的專利繳費信息時，應按類型分別生成訂單，並分別在銀行或郵局匯款。不同的專利類型對應不同的批量支付模板。批量導入繳費信息時，首先要選擇專利類型，然後下載費用信息模板。選擇錯誤會影響模板上傳。
3.費用通過銀行或郵局匯出，無法在匯款單上記錄所有必要的支付信息的，應在匯出日通過信息補充系統進行補充。補交信息最遲不得超過匯款次日。直接向國家知識產權局專利局(含各代辦處)繳納費用的，使用信息補充系統的，繳費信息應在繳費當日通過信息補充系統填寫。