特殊益生菌菌株的上遊產業鏈包含菌株的科學研究與專利申請、菌株知識產權的保護等方面;從生產原材料來看主要包含葡萄糖、蛋白粉、蔗糖等原料生產。
葡萄糖是有機化合物的壹種，是自然界分布最廣且最為重要的壹種單糖，其在生物學領域具有重要地位，是活細胞的能量來源和新陳代謝中間產物，即生物的主要供能物質，可作為微生物的碳源，是發酵培養基的主料，同時也可用作微生物多聚糖和有機溶劑的原料。
蛋白粉壹般是將大豆蛋白提純後得到的粉狀物，可以作為壹種針對特定人群的營養性食品補充劑，其含有的氮元素是益生菌菌株培養的重要成分之壹。
蔗糖是雙糖的壹種，由壹分子葡萄糖的半縮醛羥基與壹分子果糖的半縮醛羥基彼此縮合脫水而成。通過將甘蔗或甜菜用機器壓碎後收集糖汁，再經過過濾、漂白、煮沸、結晶等環節制成蔗糖。在益生菌培養過程中作為酵母的營養劑，為發酵過程提供能源。
中遊生產商
特殊益生菌菌株的中遊產業鏈包括Danisco、Morinagamilk、Vallio、Probi等國外企業以及科拓生物等中國企業，主要應用市場集中在歐美地區。
全球特殊益生菌菌株的主要產地分布在歐洲、北美和日本等地。其中，歐洲是第壹大產地，2020年產量為1156噸，約占全球總產量的39.38%，其次是北美，產量市場份額為29.46%，排名第三的日本占比為12.18%。
下遊客戶
特殊益生菌菌株的下遊產業鏈包括乳制品公司、膳食補充劑公司及動物飼料公司等，特殊益生菌菌株主要用於功能性食品和飲料。
機遇和風險
2020年全球特殊益生菌菌株下遊需求最大的市場是功能性食品和飲料，市場占比為75.60%，2021年擴大到75.81%。由於大眾對飲食健康的需求越來越大，北京研精畢智預計功能性食品和飲料行業未來仍將是特殊益生菌菌株的最大應用市場。