曙光4000A高性能計算機系統是中科院計算所國家智能計算機研發中心承擔的“高性能計算機及其核心軟件”專項。該系統於2004年6月29日通過鑒定，並於2004年8月作為國家863計劃支持的中國國家計算機網格的主節點落戶上海超級計算中心。曙光4000A是我國第壹臺商用超級計算機，由計算與曙光公司研制成功。運算速度超過每秒10萬億次。開發了壹套具有自主知識產權的集群系統軟件(包括通信、文件系統、資源管理系統和作業管理系統)，互聯網成功達到國際先進水平。曙光4000A在全球率先推出具有自主知識產權的高密度主板和64位驍龍機架式服務器，高度為2U，4個CPU。它在75平米內聚集了超過11萬億次的計算能力，散熱僅380 kW。曙光4000A系統集成了主板管理、硬件監控、KVM切換、系統電源控制等大規模集群的管理功能，提高了系統的可管理性。還支持32/64位計算、集群/MPP計算、交互/協作計算、服務器聚合計算、Wintel(微軟intel)模式等多種計算模式，極大地提高了系統服務用戶各種需求的能力，使曙光4000A系統在網格環境的應用中獨樹壹幟。曙光4000A擁有自主研發的集群系統軟件，包括集群管理系統、集群部署系統、集群作業管理系統、並行文件系統、集群監控系統、集群並行通信系統、集群高可用系統、集群負載均衡系統等。作為國家電網的主節點，曙光4000A還搭載了自主研發的各種網格使能技術，包括網格計算環境軟件和自主研發的網格部件。