面對歷史機遇和挑戰，黨的十六大高瞻遠矚，進壹步明確把加快科技進步放在經濟社會發展的關鍵位置。科學制定了走新型工業化道路、大力實施科教興國戰略和可持續發展戰略、全面建設小康社會、實現中華民族偉大復興的宏偉目標。隨著我國社會、經濟和科技事業的快速發展，黨中央、國務院提出，要把推進科技自主創新擺在各項科技工作的突出位置，把提高科技自主創新能力作為推進經濟結構調整、提高國家競爭力的中心環節，加快建設國家創新體系。自主創新已成為新世紀中國科技發展的新戰略。
“十五”期間，在黨中央、國務院的正確領導下，全國科技界深入貫徹“三個代表”思想，團結協作，開拓創新。根據世界經濟和科技發展的新形勢，特別是加入世貿組織後我國科技發展面臨的機遇和挑戰，進壹步明確了“創新和產業化”的指導方針，同時對科技發展的總體思路進行了重大調整，在“推動產業技術升級”和“提高科技持續創新能力”兩個層面作出了戰略安排。
圍繞我國“十五”科技發展目標，對國家科技計劃體系進行了重大調整，組織實施了“十五”計劃，由國家高技術研究發展(863)計劃、國家重點科研計劃、基礎研究計劃、研發條件建設、科技產業化環境建設五部分組成，將項目、人才、基地建設與制度環境建設相結合。
針對加入世界貿易組織後的形勢，中國科技界抓住機遇，迎接挑戰，大力實施“人才、專利、技術標準”三大戰略。同時，為在21世紀快速搶占壹批科技制高點，力爭實現重大關鍵技術突破，實現產業化，啟動實施了“超大規模集成電路與軟件”等12重大科技專項。重大科技項目的實施，是科技工作面向國民經濟和社會發展主戰場、實現跨越式發展的壹面旗幟，是新時期科技工作的壹項新創舉。
新世紀的第壹個五年，科技之光在中國經濟和社會發展的各個領域無處不在。科技進步已經成為中國經濟和社會發展的強大動力。
中國基礎科學研究水平穩步提高，取得了壹系列重大科學發現和發明。中國科學家在人類基因組、植物基因組、微生物基因組和家蠶基因組測序方面做出了突出貢獻。澄江動物群脊椎動物起源的研究，為解釋“寒武紀生命大爆發”提供了寶貴的科學依據。世界上二疊紀-三疊紀界線層型的研究，把大頭獸的歷史提前了4500萬年；納米材料和納米結構、量子信息技術等方面的研究成果對引領未來高科技發展具有重要意義。
中國在關系國家經濟發展和安全的重要戰略性高技術領域取得重大創新成果。在超大規模集成電路、軟件、高性能計算機、高速寬帶網絡、電動汽車、磁懸浮列車、清潔能源、特殊功能材料等領域突破和掌握了壹批關鍵技術。形成了具有自主知識產權和國際競爭力的主導產業和產品，湧現出壹批依靠自主創新獲得市場競爭力的優秀企業，培育了新的經濟增長點。
以增強裝備制造業創新能力為突破口，我國在制造業信息化應用工程、數控機床、智能工程機械裝備、自動化生產線裝備等領域取得多項重大技術突破，開發了壹批具有自主知識產權和市場競爭力的重大裝備產品，加快了用高新技術改造傳統產業的步伐。
科技進步促進了農業增產和農民增收，為解決“三農”問題做出了積極貢獻。“十五”期間，農業科技在主要農作物優質高產品種選育、農業育種、農業信息、農業節水、奶業、農產品深加工、高效農業機械等方面取得重大創新，形成了壹批新興農業高新技術產業，初步建立了我國現代農業科技創新體系，為大幅提高我國糧食綜合生產能力、保障國家糧食安全、促進農民增收提供了堅實的技術支撐。
中國科技發展始終圍繞提高人民生活質量、促進人與自然和諧發展，全面實施可持續發展戰略。在重大疾病防治、創新藥物、醫療器械和醫用材料研發、生態環境改善、能源礦產資源開發和高效利用、食品安全和生產安全等方面取得顯著成效，使我國人民切實分享科技進步帶來的好處。