首先，學科的側重點不同。
信息管理與信息系統專業是隨著信息化的發展而發展起來的壹門新興學科。它的出現主要是為了適應企業管理從手工、半手工管理向全自動管理的轉變。本專業所學的基礎知識更多的是面向企業管理，如市場營銷、戰略管理、信息系統、軟件工程、信息系統設計等學科。
信息資源管理專業是從傳統的圖書館學發展而來的，以研究傳統的文本資料和電子資料為主，其研究內容包括:從信息獲取到信息發布的全過程，如收集、分類、檢索、綜合、發布、摘要等。還涉及到信息資源管理的壹些法律法規，如知識產權、各學科信息資源整合、政府信息共享等。它更多的是圖書館學、情報學的壹個分支，內容也有偏頗。
其次，就業前景不同。
信息管理與信息系統專業在很多學校都有開設，但是不同的學校教授這個專業的方式不同。有些學校為了保證就業率，要求該方向的學生在畢業前掌握壹門編程語言，能夠獨立開發小型管理信息系統，並取得國家軟件設計師資格證書。畢業生主要從事IT行業。或者進入企事業單位做網絡中心管理員。
並不是所有的學校都能開設信息資源管理專業，但是能開設這個專業的學校壹般都比較老，大多是在圖書館學、情報學的學校開設，比如人大信息資源管理學院、武漢大學信息管理學院等。大部分學生畢業後從事公文工作，從事本專業的在高校、省市圖書館、檔案館、大企業知識管理部門工作。
最後
如果妳想在這個方向上攻讀研究生或博士以上學位，他們的專業方向會更明確。信息管理與信息系統總體研究方向是機器的智能學習，如:自動分類、自動聚類、自動業務定位、企業最優生產模式規劃、商業智能系統開發、決策支持系統開發、互聯網輿情分析等。從這些研究方向可以看出，信息管理與信息系統是研究管理科學與工程的壹門學科。
信息資源管理的研究方向比較多:知識產權管理、公共信息資源的獲取、企業信息資源結構的研究、社會網絡的構成方式等等。更強調理論。