新疆伊犁河谷的土壤因水熱狀況不同，垂直分布非常明顯，既有高山冰川、山地草甸土、山地森林土又有山地黑土、栗鈣土、棕鈣土、草甸土等。且大部分地方水草充足，氣候溫和，日照時間長，這些獨特的自然環境，為伊犁中藥材的種植提供了良好的場所。
根據伊犁州藥監部門和農業部門的普查，在伊犁河兩岸，不管是高山草甸帶，還是中低山地帶點均有藥用價值很高的植物分布，如：高山鳳毛菊、雪蓮、高山紅景天等200多種藥用植物，在雪嶺雲杉下的中低山和山前沖積平原壹帶，還分布著種類繁多的黨參、天山野罌粟、木賊麻黃、山楂、菊芭、土木香等，有些藥用植物是伊犁特有的，如伊犁貝母、新疆秦艽等，伊犁河谷中藥材資源不但分布廣泛，而且品種繁多，蘊藏量大。據州藥監局調查，這裏至少有1000多種藥用植物，是新疆藥用植物分布最多的區域，且部分中藥材為稀有品種，極具開發價值，目前該局已著手擬定伊犁州中藥材開發建議。
在伊犁中藥材開發有很好的基礎，伊犁州農村有許多農民早有采集、種植和加工地產中藥材的歷史和經驗，20世紀70年代末，伊犁州中藥材生產曾經有壹段興盛的歷史。如霍城，鞏留、伊寧縣廣泛種植伊犁貝母和紅花。新源、鞏留縣不少鄉鎮都試種過甘草、黃芪、板蘭根和柴胡。伊犁制藥廠還生產過伊犁特有產品鹿角膠和雪蓮酒等，生產的壹些中藥材不僅滿足了本地的需求，還銷往全國各地，直到現在，伊犁貝母雪蓮、肉蓯蓉、紅花等仍有中藥材市場上的熱銷貨。
從市場前景看，中醫草藥是我國人民醫療衛生保健體系的重要組成部分，目前全世界約有80%以上的人口應用植物藥進行治療，年銷售額在200億美元以上。在我國加人WTO以後，因為知識產權問題對化學藥品生產研究有較大的沖擊，而傳統中藥卻獲得了良好的發展機遇，況且種植中藥材的成本低，許多品種是地道的地產藥材，據資料顯示，僅今年前4個月，新疆中藥材出口額就達到500萬美元，比去年同期增長45%，出口市場增勢強勁，在目前種植業朝著突出區域布局方向發展的時候，在不同的適宜區，發展種植中藥材種植前景非常看好。