壹、全市各縣（市、區）***有10個職能局，內設機構分兩類設置：
（壹）麒麟區、宣威市、會澤縣、陸良縣國家稅務局設10個內設機構，分別是：辦公室、政策法規科、貨物和勞務稅科、所得稅科、收入核算科、納稅服務科、征收管理科、人事教育科、監察室、辦稅服務廳，級別為正股級。
（二）沾益縣、富源縣、馬龍縣、師宗縣、羅平縣、曲靖經濟技術開發區國家稅務局設8個內設機構，分別是：辦公室、政策法規科、稅政科、收入核算科、征收管理科、人事教育科、監察室、辦稅服務廳，級別為正股級。
二、各縣（市、區）國家稅務局均設置直屬機構1個，即稽查局，級別為副科級。
三、各縣（市、區）國家稅務局均設置事業單位1個，即信息中心，級別為正股級。
四、派出機構
全市國稅系統10個縣（市、區）局***設22個稅務分局，級別為副科級。麒麟區國家稅務局麒麟稅務分局、越州稅務分局，沾益縣國家稅務局西平稅務分局、花山稅務分局，富源縣國家稅務局中安稅務分局、營上稅務分局、黃泥河稅務分局，宣威市國家稅務局榕城稅務分局、開發區稅務分局、格宜稅務分局、羊場稅務分局、倘塘稅務分局，會澤縣國家稅務局金鐘稅務分局、者海稅務分局，馬龍縣國家稅務局第壹稅務分局、第二稅務分局，陸良縣國家稅務局第壹稅務分局、第二稅務分局，師宗縣國家稅務局丹鳳稅務分局，羅平縣國家稅務局第壹稅務分局、第二稅務分局，曲靖經濟技術開發區國家稅務局城區稅務分局。