要建立完善的內部控制系統並使之真正發揮應有的效能，就必須提高企業經營者的素質。首先，應形成壹個經理人的競爭市場，充分發揮市場優勝劣汰的競爭機制，把真正具有經營管理能力的人才吸引進來。建立健全經營者資格認定制度和選聘制度，使經營者的資格認定、任命、考核更具規範化、民主化、法制化。其次，加強對經營者的制衡約束，通過所有者約束機制、市場約束和國家法律約束來完善對公司經理層的約束機制。再次，健全經營者激勵機制，調動其積極性。可以借鑒國外經驗，推行適當的經營者持股制度，實施長期激勵。如股票期權制度，即通過讓經營者擁有壹定數量的公司股票期權，使經營者利益與公司長期利益聯系起來，實現經營者與所有者***擔風險、***享利益的壹種激勵制度。
(二)完善公司治理結構。
現代企業制度的核心是建立健全公司治理結構，而健全的公司治理結構的基礎是優化股權結構。要改變“壹股獨大”，可以逐步建立國有資本退出機制，降低公司股權的集中度，平等對待所有股東，使股東之間形成相應的牽制。針對“內部人控制”現象嚴重，首先要強化董事會在公司治理結構中的主導地位，突出董事會在建立和完善內部控制體系過程中的核心作用;其次是實行獨立董事制度，通過對董事會這壹內部機構的適當外部化，以期對內部人形成壹定的監督制約力，最大限度地維護所有股東的權益。作為健全的監事會制度應該保證監事會獨立有效地行使其對董事會的監督權，同時應賦予監事會更大的監督權力，不僅可以完善公司治理的三角制衡關系，而且會督促董事以及經理人員對內部控制的遵循與執行。
(三)設立完善的組織結構和權責分派體系。
壹個企業的組織結構的功能在於提供規劃、執行、控制和監督活動的框架，組織結構既不應簡單到使管理當局無法有效地監督企業的各項活動，也不能復雜到阻礙業務的正常進行以及必要信息的流通。企業設置組織結構，應按照相互牽制、相互協調的原則，結合企業規模、業務特點等具體情況設置職能部門並進行業務分工，以使每壹項業務的全部處理過程或過程中的重要環節，不是由壹個部門單獨辦理，而是在兩個或兩個以上的部門相互協調、相互制約的基礎上完成。對各部門既要避免權力重疊，也要防止出現權力真空，使每項業務處理的各個環節都有相應的機構負責。在具體形態上，直線——職能制的組織機構是大多數企業的較好選擇。
(四)制定適宜的人力資源政策。
科學的制度是由人來制定的，再好的制度也必須有人去執行。強調人的全面發展和綜合素質的提高，才能最大限度地減少企業內部控制中由於人事制度的缺陷所造成的失誤。現代企業應堅持以人為本的思想，制定科學合理的人力資源管理管理制度（www.chinatpm.net）：壹是要嚴把用人關，對重要崗位的人員配置和管理人員的選拔，應全面考核其綜合素質，確保各崗位人員的素質要求;二是要多層次、多方位地加強崗位和在職人員的培訓，切實提高員工的政治和業務素質，使其遵紀守法、精通業務;三是要加強職業道德教育，教育員工自覺遵守和執行內部控制制度，培養員工敬業愛崗的精神形成以自我控制為主要手段的內部控制制約機制;四是要對有些崗位實行定期或不定期輪換制度，以相互牽制、相互監督。
(五)營造優秀的企業文化。
經濟活動往往是經濟、文化壹體化的運作，經濟的發展比任何時候都呼喚文化的支持。在社會主義市場經濟實踐中，企業的形象如何，直接折射著社會的文明程度，而那種假冒偽劣、以次充好的短期行為，不但擾亂了正常的社會秩序，也可能從根本上斷送企業的發展前途。因此，企業文化應該把企業精神和企業價值觀作為核心和基石，強調對員工普遍認同的價值觀的塑造，在企業內部創造壹種和諧壹致、積極向上的文化氛圍，以發揮群體的文化優勢，增強企業的凝聚力。面對新的國內外環境變化，在當前我國的企業文化建設中，要優先樹立以人為本的觀念，樹立市場觀念，樹立用戶至上觀念，樹立人類整體觀念以及樹立社會責任感等，只有這些方面的工作做好了，企業才能持續長久地發展下去。
(六)強化內部審計。
現代內部審計活動實際上是管理的延伸，內部審計人員所從事的工作是企業管理當局想做而未能做的事情。他們的使命已不再局限於檢查發現可能存在的財會差錯，而是通過獨立的檢查和評價活動，針對內部控制的缺陷、管理的漏洞，提出切實可行的、富有建設性的建議和措施，促進管理當局進壹步改善經營管理，提高企業的綜合實力。在我國目前的企業治理結構下，既然建立內部控制的責任在董事會，那麽董事會勢必關註內部控制的執行情況，要有信息的反饋和傳遞，內部審計正是溝通董事會與經營管理層的最好橋梁。因此就在董事會內設置內部審計機構，以提高內部審計的獨立性，即股東會通過監事會對董事會實施內控，董事會通過內部審計對總經理及其它管理者實施內控，形成相互聯系、相互制約的嚴密內控系統。
總之，良好的內部控制有賴於積極的、與之匹配的控制環境的支持。優化企業內部控制環境，是提高經營管理水平的基礎性工作，也是不可回避的現實需要。隨著我國市場經濟的發展，經濟全球化的形成，現代企業只有通過建立良好的內部控制環境，才能提高經營管理效率，在未來激烈的競爭中求得生存和發展。