第壹，開票系統有紅字發票。先在開票系統中填寫紅字申請表，填好後保存，打印兩份加蓋單位財務印章，將電子申請表從開票系統導出到u盤，連同其他材料壹起帶到稅務局。
稅務局核對完所有信息後，還會給出電子紅字發票通知單，帶回導入開票系統開具紅字增值稅。
二、買方向主管稅務機關申請《紅字增值稅專用發票申請表》:
1.買方已“認證壹致”，並已扣除增值稅。需要在主管稅務機關用紅字填寫《開具增值稅專用發票申請表》，不需要用藍色填寫相應的增值稅專用發票信息。
經主管稅務機關審核確認後，開具紅字增值稅專用發票通知單，相應列明的增值稅金額由買方當期進項稅額轉出。
買方取得紅字專用發票後，連同留存的《開具紅字增值稅專用發票通知書》作為記賬憑證。
2.增值稅專用發票為“納稅人識別號認證不壹致”或“專用發票代碼與號碼認證不壹致”的，在向主管稅務機關填寫《開具紅字增值稅專用發票申請表》時，
您需要填寫相應的藍字增值稅專用發票信息，經主管稅務機關審核確認後，開具《開具紅字增值稅專用發票通知書》。此時作為買方的增值稅專用發票還沒有在系統中認證，買方不需要轉出進項稅。
擴展數據:
壹、買方
1.如果買方已認證的增值稅發票因退貨或開票錯誤需要開具負發票，買方應申請開具負發票。
2.無法認證專用發票抵扣聯和發票聯的，由購買方填寫《開具紅字增值稅專用發票申請表》，在申請表上填寫具體原因及對應的藍字專用發票信息，主管稅務機關審核後開具《開具紅字增值稅專用發票通知書》。買方不會轉出進項稅。
3.買方購買的貨物不屬於增值稅抵扣範圍，且取得的專用發票未經認證的，由買方填寫申請表，在申請表上用藍色填寫具體原因及相應專用發票的信息，主管稅務機關審核後開具通知書。買方不會轉出進項稅。
第二，賣方
賣方開具負發票的申請(前提是發票未認證，且發票在180天認證期內)如下:
1.如果買方因開具發票錯誤而拒收專用發票，賣方應在專用發票認證期內向主管稅務機關填寫申請表，並在申請表上用藍色填寫具體原因及相應專用發票的信息。
2.如因開票錯誤等原因導致專用發票未送達買方，賣方應在開具錯誤專用發票的次月內向主管稅務機關填寫申請表，並在申請表上以藍色填寫具體原因及相應專用發票的信息，同時提供賣方出具的說明具體原因、具體錯誤項目及正確內容的書面材料。
發生銷售退貨或銷售折扣的，除按《通知》規定辦理外，賣方還應在開具紅色專用發票後，將此項業務相應的會計憑證復印件報送主管稅務機關備案。
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