1，管理範圍太大，征稅成本太高。從管理範圍來看，目前我國壹線執法的稅務人員較少，實行稅收管理員制度必然導致管理範圍過大。從征稅成本來看，目前中國的征稅成本是美國的十倍。為實現精細化管理，應增加稅收管理員的數量，加強培訓，提高稅收管理員的專業素質，從而提高單位征管效率。無論哪壹種都會再次增加征稅成本，這顯然與國家征管目標相違背。
2.保姆管理沒有取消，激勵機制沒有建立。市場經濟的原則要求權利、責任和利益掛鉤。目前，每個稅收管理員負責數百名納稅人。他平時對納稅企業進行日常稅務管理，承擔納稅輔導等九項職責，對所管理的事務和家庭負全部責任。但客觀上，稅務管理人員不可能像保姆壹樣24小時盯著納稅人。即使稅務管理員整天盯著納稅人，也不能保證不出問題，更何況每個稅務管理員還要管理幾百家企業。同時還要面對稅務稽查部門的檢查。而稅收管理員的制度並沒有設置壹套相應的獎懲機制，導致多勞少得，好的工作和不好的工作都是壹樣的。
3.稅務管理人員和稅務機關的責任風險急劇增加。現在是“法”的時代，每個人都要為自己的行為承擔法律責任。稅務管理員每完成壹項工作，都要向局內相關職能部門和納稅人發放稅務文書。這種稅務文書使稅務管理人員承擔兩大責任:壹是管理納稅人的責任。比如，由於納稅人在財務和納稅中采用欺騙、隱瞞等手段，稅務管理人員出具的單據不真實，稅務管理人員很難對其進行查處。二是對稅務機關其他部門的責任。比如，虛開增值稅專用發票後，納稅人的“逃”行為，稅收管理員要負全責。因為稅收管理員代表稅務機關監督納稅人納稅，開具稅務文書，當稽查部門再次查出問題時，稅收管理員是逃不掉的。所以有人說:“稅務管理員的日子可謂‘如履薄冰’。”仔細分析，不僅稅收管理員要對上述行為負責，相應的稅務機關也要對稅收管理員的行為負責，因為稅收管理員代表的是他的稅務機關。
更棘手的問題是，在稅收管理員制度下，如何解決納稅人與稅務機關之間的糾紛。我們假設納稅人以會計師事務所審計報告、壹線稅務人員作出的結論、檢查處理決定等不壹致的文件向稅務機關提起訴訟會怎麽樣？在我國很多地方，納稅人偷稅和稅務管理人員“坐在壹起”，可以說給了我們對上述問題可笑又無奈的答案。按照上述推理，我們不得不接受壹個更無奈的法律事實:以稅收管理員為代表的稅務機關也應包括在內。無疑，是“稅收管理員制度”使稅收管理員和稅務機關在“法律”面前處於尷尬和被動的地位；同時，可悲的是，這在壹定程度上為納稅人減輕甚至免除罪責創造了條件。追根溯源，癥結在於“稅收管理員制度”。