個人所得稅超過5000扣稅算法：
應納稅所得額=月度收入-5000元(起征點)-專項扣除(三險壹金等)-專項附加扣除-依法確定的其他扣除。
例：已婚人士小李在北京上班，月收入1萬元，“三險壹金”專項扣除為2000元，每月租金4000元，有壹子女上幼兒園，同時父母已經60多歲。起征點為3500元的情況下，沒有專項附加扣除，每月需繳納345元個稅;起征點為5000元的情況下，沒有專項附加扣除，每月需繳納(10000-5000-2000)×3%=90元個稅。根據新政策，小李就可以享受住房租金1200元扣除、子女教育1000元扣除、贍養老人1000元扣除(跟姐姐分攤扣除額)，所以，個稅=(10000-5000-2000-1200-1000-1000)×3%=0元。
征收管理：
中國個人所得稅的征收方式實行源泉扣繳與自行申報並用法，註重源泉扣繳。個人所得稅的征收方式可分為按月計征和按年計征。個體工商戶的生產、經營所得，對企業事業單位的承包經營、承租經營所得，特定行業的工資、薪金所得，從中國境外取得的所得，實行按年計征應納稅額，其他所得應納稅額實行按月計征。
個人所得稅是調整征稅機關與自然人(居民、非居民人)之間在個人所得稅的征納與管理過程中所發生的社會關系的法律規範的總稱。
法律依據
《財政部、稅務總局關於2018年第四季度個人所得稅減除費用和稅率適用問題的通知》
壹、關於工資、薪金所得適用減除費用和稅率問題
對納稅人在2018年10月1日（含）後實際取得的工資、薪金所得，減除費用統壹按照5000元/月執行， 並按照本通知所附個人所得稅稅率表壹計算應納稅額。對納稅人在2018年9月30日（含）前實際取得的工資、薪金所得，減除費用按照稅法修改前規定執行。