國家稅務局系統由國家稅務總局垂直領導；省級地方稅務局受省級人民政府和國家稅務總局雙重領導，省級以下地方稅務局系統由省級地方稅務機關垂直領導。因此，國家稅務局系統和地方稅務局系統分屬國家不同的職能部門，壹般是分開辦公的，但是，也由壹些地方的國家稅務局系統和地方稅務局系統是合署辦公的。
我國現行稅種***有24個，按照財政分稅制的要求，將24個稅種按照實際情況劃分為中央稅、中央與地方***享稅、地方稅三種。其中，中央稅歸中央所有，地方稅歸地方所有，中央與地方***享稅分配後分別歸中央與地方所有。
為適應分稅制的要求，全國稅務機關分為國家稅務局（簡稱國稅）和地方稅務局（簡稱地稅），負責征收不同的稅種。國稅主要負責征收中央稅、中央與地方***享稅，地稅主要負責征收地方稅，他們之間的征收管理分工壹般劃分如下：
1。國稅局系統：增值稅，消費稅，車輛購置稅，鐵道部門、各銀行總行、各保險總公司集中繳納的營業稅、所得稅、城市建設維護稅，中央企業繳納的所得稅，中央與地方所屬企業、事業單位組成的聯營企業、股份制企業繳納的所得稅，地方銀行、非銀行金融企業繳納的所得稅，海洋石油企業繳納的所得稅、資源稅，外商投資企業和外國企業所得稅，證券交易稅（開征之前為對證券交易征收的印花稅），個人所得稅中對儲蓄存款利息所得征收的部分，中央稅的滯納金、補稅、罰款。
2。地稅局系統：營業稅、城市維護建設稅（不包括上述由國家稅務局系統負責征收管理的部分），地方國有企業、集體企業、私營企業繳納的所得稅、個人所得稅（不包括對銀行儲蓄存款利息所得征收的部分），資源稅，城鎮土地使用稅，耕地占用稅，土地增值稅，房產稅，城市房地產稅，車船使用稅，車船使用牌照稅，印花稅，契稅，屠宰稅，筵席稅，農業稅、牧業稅及其地方附加，地方稅的滯納金、補稅、罰款。
為了加強稅收征收管理，降低征收成本，避免工作交叉，簡化征收手續，方便納稅人，在某些情況下，國家稅務局和地方稅務局可以相互委托對方代收某些稅收。另外，對於特殊情況，國家稅務總局會對某些稅種的征收系統，做出特別的安排和調整。
因此，納稅人涉及具體稅種應當向哪個稅務系統繳納問題時，還是應當以當地主管國家稅務機關和地方稅務機關的實際分工及其具體要求為準。
壹、基本稅種
1、營業稅按提供的服務收入5%繳納；
2、增值稅按銷售收入17%、6%、4%繳納（分別適用增值稅壹般納稅人、小規模生產加工納稅人和商業企業納稅人）
3、城建稅按繳納的營業稅與增值稅之和的7%繳納；
4、教育費附加按繳納的營業稅與增值稅之和的3%繳納；
5、地方教育費附加按繳納的營業稅與增值稅之和的2%繳納；
6、印花稅：購銷合同按購銷金額的萬分之三貼花；帳本按5元/本繳納（每年啟用時）；年度按“實收資本”與“資本公積”之和的萬分之五繳納（第壹年按全額繳納，以後按年度增加部分繳納）；
7、城鎮土地使用稅按實際占用的土地面積繳納（各地規定不壹，XX元/平方米）；
8、房產稅按自有房產原值的70%*1.2%繳納；
9、車船稅按車輛繳納（各地規定不壹，不同車型稅額不同，XX元輛）；
10、企業所得稅按應納稅所得額（調整以後的利潤）繳納（3萬元以內18%，3萬元至10萬元27%，10萬元以上33%）；
11、發放工資代扣代繳個人所得稅。
上述稅種中除增值稅與企業所得稅（2002年1月1日新設立的企業）向國稅局申報繳納外，其他均向地稅局申報繳納。
二、納稅申報期限
1、營業稅、增值稅、城建稅、教育費附加、個人所得稅等於次月10日內為限期繳納期限；
2、企業所得稅季後15日內（當地稅務機關確認按月繳納的，次月10日）為限期繳納期限，匯算清繳期限為4個月；
3、房產稅、城鎮土地使用稅、車船稅等，按當地稅務機關的規定期限繳納（各地壹般壹年兩次等規定不壹）。
4、限期繳納最後壹日，遇到休息日，順延壹日；遇到長假（春節、五壹、十壹節），按休息日順延；
5、滯納金按天加收萬分之五；
6、經稅務機關責令限期繳納後仍未繳納的，稅務機關可處於罰款。