地稅來講：
1.要是用稅控機的話，稅務局會把每個月報的稅金額和稅控機裏面每月開發票對應的稅額進行核對，來看單位是否存在多開票的問題。
不過壹般單位都是票開的少，稅交的多。
2.地稅還有可能定期要檢查單位的作廢發票是否保存完整，看是不是有倒賣發票的嫌疑（即開了發票，再作廢掉，把發票賣給被人）
3.地稅還可以進行實地核查帳薄看是不是有改做收入的沒列到收入中來。
壹般地稅核查的重點是印花稅，因為很多單位都沒有及時貼花而且很多財務人員對於印花稅把握的也不夠準。
4.地稅的另外壹個核查重點就是個人所得稅了，壹般都會翻翻報銷單，看看有沒有視同收入的個人費用報銷。在北京比如說報銷禮品啊，報銷汽油費，或者其他他們覺得與企業經營無關的費用。這都是要補稅。
5.個稅裏面還有就是單位給個人的補充醫療保險之類的有沒有當月算入員工收入補稅。
國稅，主要關註的是所得稅，當然也有增值稅和消費稅，但我碰到的檢查裏面基本上都是查所得稅
1.壹般都是實地核查或者把單位的賬或憑證抱過去。或慢慢翻看，看裏面有沒有與單位經營無關的，或者有些發票的擡頭之類的是否合規（壹般這都是有點找茬）
2.關註重點是，企業的相關的財產損失（固定資產報損、壞賬計提等）。
3.還關註福利費的支出，比如福利費相關支出是否是都是福利類的支出，有沒有像餐費這種也計入福利費的啊。
4.企業大額的報銷票據，比如說會議費，辦公費都必須有相關的支持材料。會議費應該有會議通知，會議紀要，或其他能證明確實開過會，而不是弄來的票或者個人吃飯開的票。
大額辦公費應該要附辦公費的明細列表，得要說明這麽多錢買的辦公用品到底是什麽，而不是家裏面買的東西在超市或商場開的票。
總而言之，只要稅務局想查，沒有查不出來的問題。千萬別認為自己單位的賬做的規範，無懈可擊，那是根本不可能。