自2000年以來，科倫藥業連續被評為“四川省重點優勢企業”，並保持至今。2004年科倫藥業已進入中國民營企業納稅50強，是四川省唯壹獲此殊榮的民營企業。2005年2月，“科倫”牌輸液系列產品被評為“中國馳名品牌”；2006年8月，“科倫”牌輸液系列產品被評為“中國輸液藥品消費者滿意最具影響力品牌”，幾億受眾的口碑相傳使科倫品牌堅如磐石。2007年8月15日，公司被四川省人民政府授予四川省高新技術產業(骨幹類、新材料領域)示範企業稱號。 2011年入選首批“國家技術創新示範企業” 。
公司1997年即創建了科倫藥物研究所，每年投入數千萬元於醫藥研發，已完全掌握輸液生產核心技術。科倫藥物研究所被批準為國家博士後科研工作站，已獲得十余項發明專利、4項實用新型專利及4項外觀設計專利，並有20余項專利正在申請受理中。公司被評為“國家火炬計劃重點高新技術企業”。2005年，科倫自主研發的直立式軟袋成功問世，在國內外均屬首創。它比傳統的開放式玻瓶輸液具有更高的安全性和性價比，在降低能耗和環境保護方面也有巨大的應用價值，代表著未來中國輸液產業發展的方向，足以改變現行的行業格局。
公司被四川省人民政府授予“四川省高新技術產業(骨幹類、新材料領域)示範企業”稱號；2008年12月30日，公司經四川省科學技術廳、四川省財政廳、四川省國家稅務局和四川省地方稅務局聯合認定為“高新技術企業”；2009年4月，國家工商行政管理總局商標局認定公司註冊並使用的“科倫”註冊商標為“中國馳名商標”；2011年4月，被國家科技部、國務院國資委、中華全國總工會聯合審定為“國家第三批創新型企業”；2011年6月，被工業和信息化部、財政部聯合認定為首批“國家技術創新示範企業”，成為四川省內唯壹獲此殊榮的醫藥企業；2011年11月，被國家發改委認定為“國家地方聯合工程實驗室”，2011年組建了企業院士工作站。公司榮獲4項國家新藥創制重大專項和1項國家科技支撐項目的立項支持。