1.營業稅分階段區別征稅。土地使用權的投資，稅收上認定屬土地使用權無形資產轉讓，但投資行為是不征收營業稅的。《國家稅務總局關於印發<營業稅稅目註釋（試行稿） >的通知》（國稅發[1993]149號）規定：以不動產投資入股，參與接受投資方利潤分配，***同承擔投資風險的行為，不征營業稅。但轉讓該項股權，應按本稅目征稅。也就是說，投資人土地投資獲得股權時不征稅，但在轉讓該項股權時需要納稅。自2003年1月1日起，稅收政策對此進行了調整，取消了股權轉讓環節征稅的規定。《財政部、國家稅務總局關於股權轉讓有關營業稅問題的通知》（財稅[2002]191號）規定：以無形資產、不動產投資入股，與接受投資方利潤分配，***同承擔投資風險的行為，不征收營業稅。同時規定“對股權轉讓不征收營業稅”。
2.單位和個人所得稅征稅待遇不同。對於單位的投資行為需要，其土地評估增值部分需要按規定繳納企業所得稅。《國家稅務總局關於企業股權投資業務若幹所得稅問題的通知》（國稅發[2000]118號）規定：企業以經營活動的部分非貨幣性資產對外投資，包括股份公司的法人股東以其經營活動的部分非貨幣性資產向股份公司配購股票，應在投資交易發生時，將其分解為按公允價值銷售有關非貨幣性資產和投資兩項經濟業務進行所得稅處理，並按規定計算確認資產轉讓所得或損失。上述資產轉讓所得如數額較大，在壹個納稅年度確認實現繳納企業所得稅確有困難的，報經稅務機關批準，可作為遞延所得，在投資交易發生當期及隨後不超過5個納稅年度內平均攤轉到各年度的應納稅所得中。《中華人民***和國企業所得稅法實施條例》第二十五條也將這種以土地使用權換取股權的“非貨幣性資產交換”行為，按視同銷售處理。
但在個人以土地投資上，稅收政策上規定暫時不征個人所得稅。《國家稅務總局關於非貨幣性資產評估增值暫不征收個人所得稅的批復》（國稅函[2005]319號）規定：考慮到個人所得稅的特點和目前個人所得稅征收管理的實際情況，對個人將非貨幣性資產進行評估後投資於企業，其評估增值取得的所得在投資取得企業股權時，暫不征收個人所得稅。在投資收回、轉讓或清算股權時如有所得，再按規定征收個人所得稅，其“財產原值”為資產評估前的價值。
3.印花稅區別時段征免稅。《國家稅務局關於印花稅若幹具體問題的解釋和規定的通知》（國稅發[1991]155號）規定：土地使用權出讓、轉讓書據（合同），不屬於印花稅列舉征稅的憑證，不貼印花。而在2006年11月27日下發的《財政部國家稅務總局關於印花稅若幹政策的通知》（財稅[2006]162號）文件規定：對土地使用權出讓合同、土地使用權轉讓合同按產權轉移書據征收印花稅。
4.土地增值稅由全部免稅到部分征稅。《財政部國家稅務總局關於土地增值稅壹些具體問題規定的通知》（財稅字[1995]048號）規定：對於以房地產進行投資、聯營的，投資、聯營的壹方以土地（房地產）作價入股進行投資或作為聯營條件，將房地產轉讓到所投資、聯營的企業中時，暫免征收土地增值稅。對投資、聯營企業將上述房地產再轉讓的，應征收土地增值稅。顯然，上述規定對土地投資采取的是鼓勵政策。但隨著國家對房地產市場的政策調控需要，《財政部國家稅務總局關於土地增值稅若幹問題的通知》（財稅[2006]21號）對此作了調整。該文規定，自2006年3月2日起，對於以土地（房地產）作價入股進行投資或聯營的，凡所投資、聯營的企業從事房地產開發的，或者房地產開發企業以其建造的商品房進行投資和聯營的，均不適用財稅字[1995]048號暫免征收土地增值稅的規定。很明顯，上述政策的改變僅是針對房地產企業的。
5.契稅不能免征。《中華人民***和國契稅暫行條例細則》第八條規定，以土地、房屋權屬作價投資、入股，視同土地使用權轉讓、房屋買賣或者房屋贈與征稅。但是，契稅是由被投資人繳納。