項目於1990年7月開工建設，於1998年6月30日試運行，2009年竣工驗收。目前，除浦城系統外，其他項目已全部完成，完成率超過98%。目前已建成泵站38座，安裝水泵機組172臺。9條幹渠長128.94公裏，59條支渠長379.98公裏。灌區配套面積69萬畝。截至2007年6月底，黃兒灌區已從渠首引水33億立方米，使用桶裝水65438億立方米，灌溉農田2550多萬畝。灌區糧食年產量穩定在1000公斤以上，復種指數在150%-180%之間。受益地區的社會效益增加了100多億元，經濟效益十分顯著。
渭南市董磊黃河抽水工程管理局成立於1989年4月，2011年6月更名為董磊黃河抽水工程管理局。是市水務局下屬的差額撥款準公益性事業單位。主要負責董磊二期引黃工程的建設、管理和維護，基礎設施尾礦工程和灌區配套工程的建設和管理，渭南城區和工業園區農業灌溉抗旱工作和供水工程的組織實施。
辦公室下設辦公室、人事處、財務計劃處、機電處、灌溉處、工業管理處、監察室、工會辦公室等12個職能部門，直屬單位16個。辦公室設在朝陽街中段的祥龍酒店院內。