法律分析：藥品稅率有以下兩種情形：
1、交定稅，比如每月交1000元稅，或500元稅，視店大店小而定，且各地掌控標準不壹，它的制訂也是根據藥店平均的月收入制訂的，類似包幹，收入多了也不多交，少了也不少交，每年核定壹次，有利於稅務核算，個體藥店基本上都采用這種納稅方式，所以，不好說3000元的發票應納多少稅，因為月交稅額固定，但收入是變動的，但壹般說也在2至百分之六之間
2、按收入和應稅率交稅，國稅率百分之四，另外還有壹點地稅，總的算起來在百分之五左右，所以，這種情況下開的3000元發票應交150元左右的稅金。
大型零售藥店有不少是壹般納稅人。壹般納稅人進項額抵扣百分之十七，銷售收入納稅也是百分之十七，應稅額是增值的那部分即增值稅，交稅額是增值部分的百分之十七。所以，增值越大毛利越大，納稅越多，反之亦然。所以，交稅額大小也是變動的，只有藥店核算時知道。壹般講，應交稅率也在3至百分之七之間。
稅率是指納稅人的應納稅額與征稅對象數額之間的比例，是法定的計算應納稅額的尺度。稅率的高低直接關系到國家財政收入的多少和納稅人負擔的輕重，體現了國家對納稅人征稅的深度，是稅收制度的核心要素。
比例稅率，即對同壹征稅對象，不論其征稅數額的大小，都采取同壹比例的稅率征稅，壹般適用於對流轉額等征稅對象的征稅。比例稅率的特點是征收效率高，但稅率具有累退性，不符合公平原則的要求。
比例稅率在具體運用中有單壹比例稅率、幅度比例稅率、差別比例稅率又分為產品差別比例稅率、行業差別比例稅率、地區差別比例稅率等形式。
法律依據：《中華人民***和國稅收征收管理法》 第三條 稅收的開征、停征以及減稅、免稅、退稅、補稅，依照法律的規定執行律授權國務院規定的，依照國務院制定的行政法規的規定執行。任何機關、單位和個人不得違反法律、行政法規的規定，擅自作出稅收開征、停征以及減稅、免稅、退稅、補稅和其他同稅收法律、行政法規相抵觸的決定。