電子稅務局認證流程如下：
1、進入各省的“電子稅務局”。
2、點擊“我要辦稅”中的“發票使用”按鈕。
3、進入後，點擊下方的“增值稅發票選擇確認平臺”。
4、插上稅控盤，登錄“增值稅發票選擇確認平臺”。
5、點擊“抵扣勾選”中的“發票抵扣勾選”。
6、勾選需要抵扣的發票，點擊“提交”。
7、點擊“抵扣勾選”中的“抵扣勾選統計”。
8、點擊“申請統計”，等待壹段時間，刷新後可以看到前面勾選的發票。
9、最後點擊“確認簽名”，完成抵扣。
從銷項電子發票的集中化和自動化開具，到開票之後的交付、歸集、查驗、比對、抵扣、存檔等電子發票全生命周期的數字化流程管理，不僅避免了線下傳遞的耗時長、易斷點等痛點，而且通過發票最後壹公裏的數字化推動內部資源整合和外部產業鏈協同網絡的形成，激發市場活力，為企業創造良好的營商環境。
壹、發票抵扣勾選
操作流程:1。在增值稅發票綜合服務平臺抵扣勾選頁面點擊發票抵扣勾選按鈕，勾選狀態選擇未勾選，根據需要輸入或選擇相關查詢條件，完成後點擊查詢按鈕，即可查詢出符合條件的全部發票。
2。確認本次需要勾選的發票全部勾選完成後，點擊提交按鈕，彈出勾選認證信息對話框，確認無誤後點擊確定按鈕進行保存處理。
二、發票批量抵扣勾選
操作流程:1。進入抵扣勾選頁面，點擊發票批量抵扣勾選按鈕。
2。進入發票批量抵扣勾選，點擊下載發票文件下載發票信息，保存信息後，點擊上傳上傳對應的發票信息。
3。保存信息後，點擊上傳上傳對應的發票信息，檢查需要勾選的發票信息點擊查詢按鈕，查看符合條件的發票合計信息。
4。點擊全部勾選在彈出的對話框點擊確定按鈕，操作完成。
三、發票不抵扣勾選
操作教程:1。進入抵扣勾選頁面，點擊發票不抵扣勾選按鈕。
2。根據需要輸入或選擇相關查詢條件，然後點擊查詢按鈕。
3。在不抵扣勾選區域顯示出符合查詢條件的發票，並填寫不抵扣原因，確認本次需要不抵扣勾選的發票全部勾選完成後。
4。下拉點擊提交按鈕，在彈出的勾選認證信息對話框，確認信息無誤後，點擊確定按鈕，保存信息。
四、發票批量抵扣勾選
操作教程:1。進入抵扣勾選頁面，點擊逾期發票抵扣勾選按鈕。
2。進入逾期抵扣申請頁面，然後點擊右側手工錄入。
3。在彈出的信息框填寫發票代碼，發票號碼，開票信息等，確認無誤後勾選紅色提醒字體，點擊確定提交按鈕。
五、出口轉內銷發票勾選
操作教程:1。進入抵扣勾選頁面，點擊出口轉內銷發票勾選按鈕。
2。根據需要輸入或者選擇相關查詢條件，點擊查詢按鈕在出口轉內銷發票不抵扣勾選區域顯示出符合查詢條件的發票。
3。確認本次需要勾選的發票全部勾選完成後，點擊提交按鈕，完成。
六、發票批量抵扣勾選
操作教程:1。進入抵扣勾選頁面，點擊抵扣勾選統計按鈕。
2。點擊申請統計生成統計報表，確認數據後，點擊確定按鈕進行確認，輸入正確的確認密碼，點擊確定，操作完成。
希望以上內容能對您有所幫助，如果還有問題請咨詢專業律師。
法律依據：
《中華人民***和國稅收征收管理法》第六十三條
納稅人偽造、變造、隱匿、擅自銷毀帳簿、記帳憑證，或者在帳簿上多列支出或者不列、少列收入，或者經稅務機關通知申報而拒不申報或者進行虛假的納稅申報，不繳或者少繳應納稅款的，是偷稅。對納稅人偷稅的，由稅務機關追繳其不繳或者少繳的稅款、滯納金，並處不繳或者少繳的稅款百分之五十以上五倍以下的罰款；構成犯罪的，依法追究刑事責任。