有如下區別：
1．發票的印制要求不同：根據新的《稅收征管法》第二十二條規定："增值稅專用發票由國務院稅務主管部門指定的企業印制；其他發票，按照國務院主管部門的規定，分別由省、自治區、直轄市國家稅務局、地方稅務局指定企業印制。
未經前款規定的稅務機關指定，不得印制發票.
2．發票使用的主體不同：增值稅專用發票壹般只能由增值稅壹般納稅人領購使用，小規模納稅人需要使用的，只能經稅務機關批準後由當地的稅務機關代開。
普通發票則可以由從事經營活動並辦理了稅務登記的各種納稅人領購使用，未辦理稅務登記的納稅人也可以向稅務機關申請領購使用普通發票。
3．發票的內容不同：增值稅專用發票除了具備購買單位、銷售單位、商品或者服務的名稱、商品或者勞務的數量和計量單位、單價和價款、開票單位、收款人、開票日期等普通發票所具備的內容外，還包括納稅人稅務登記號、不含增值稅金額、適用稅率、應納增值稅額等內容。
4．發票的聯次不同："增值稅專用發票有四個聯次和七個聯次兩種，第壹聯為存根聯(用於留存備查)，第二聯為發票聯(用於購買方記賬)，第三聯為抵扣聯(用作購買方扣稅憑證)，第四聯為記賬聯(用於銷售方記賬)。
七聯次的其他三聯為備用聯，分別作為企業出門證、檢查和倉庫留存用；普通發票則只有三聯，第壹聯為存根聯，第二聯為發票聯，第三聯為記賬聯。
增值稅專用發票與增值稅普通發票（俗稱：普通發票）的區別在於：取得發票的納稅人是否可以依法抵扣購貨進項稅額。對於增值稅專用發票，購貨方可以憑抵扣聯，依法申報認證抵扣進項稅額，而普通發票，購貨方不能抵扣進項稅額。?
在發票內容的構成要素上，增值稅專用發票將票面金額壹分為二，勾稽關系為“金額 + 稅額 = 價稅合計”，其中：“金額 * 稅率 = 稅額”。
由於普通發票不具有抵扣進項稅額的功能，因此，無需將價稅分列開具，只需將價稅合計合並開具為“金額”。
另外，在其他方面也有不同之處，如：增值稅專用發票需列明購銷雙方的稅務登記號，等。這些不同之處均是增值稅專用發票具有抵扣功能所致。 ?
發票的作用不同：增值稅專用發票不僅是購銷雙方收付款的憑證，而且可以用作購買方扣除增值稅的憑證；而普通發票除運費、收購農副產品、廢舊物資的按法定稅率作抵扣外，其他的壹律不予作抵扣用。
普通發票是指增值稅專用發票以外的納稅人使用的其他發票。
增值稅專用發票只有增值稅壹般納稅人和稅務機關為增值稅小規模納稅人代開時使用。納稅人要從事正常的生產經營活動，壹方面要向收款方索取發票，同時也要向付款方開具發票。
特別是增值稅制實行憑票抵扣稅款制度，發票已不僅僅是商事憑證，也是稅款繳納和抵扣的憑證。
增值稅專用發票也是發票的壹種，具有增值稅壹般納稅人資格的企業都可以到主管國稅部門申請領購增值稅發票，並通過防偽稅控系統開具.具有增值稅壹般納稅人資格的企業可以憑增值稅發票抵扣增值稅。
擴展資料
壹、增值稅普通發票的格式、字體、欄次、內容與增值稅專用發票完全壹致，按發票聯次分為兩聯票和五聯票兩種，基本聯次為兩聯，第壹聯為記賬聯，銷貨方用作記賬憑證;第二聯為發票聯，購貨方用作記賬憑證。此外為滿足部分納稅人的需要，在基本聯次後添加了三聯的附加聯次，即五聯票，供企業選擇使用。
二、增值稅普通發票第二聯(發票聯)采用防偽紙張印制。代碼采用專用防偽油墨印刷，號碼的字型為專用異型體。各聯次的顏色依次為藍、橙、綠藍、黃綠和紫紅色。
三、凡納入"壹機多票"系統(包括試運行)的壹般納稅人，自納入之日起，壹律使用全國統壹的增值稅普通發票，並通過防偽稅控系統開具。
對於壹般納稅人已領購但尚未使用的舊版普通發票，由主管稅務機關限期繳銷或退回稅務機關;經稅務機關批準使用印有本單位名稱發票的壹般納稅人，允許其暫緩納入"壹機多票"系統，以避免庫存發票的浪費，但最遲不得超過2005年年底。
四、增值稅普通發票的價格由國家發改委統壹制定。
五、各級稅務機關要高度重視"壹機多票"系統的試運行工作，切實做好新舊普通發票的銜接工作。要掌握情況，統籌布置，合理安排.確保"壹機多票"系統順利推行。
參考資料：