認證按其方式可分為遠程認證和上門認證。
在遠程認證中，納稅人掃描識別專用發票的票面信息，生成電子數據，通過網絡傳輸給稅務機關。稅務機關完成解密和認證，並將認證結果信息返回給納稅人的認證方式。
現場認證是指納稅人攜帶專用發票抵扣聯(或電子信息)等材料到稅務機關申報征收窗口進行認證的方式。
比對是稅務機關利用計算機網絡，將增值稅壹般納稅人(以下簡稱納稅人)申報認證的增值稅專用發票(以下簡稱發票)抵扣情況與存根聯逐壹核對(並將抵扣聯與紅字發票存根聯核對)的壹種日常增值稅稽核管理方式。
擴展數據:
取得增值稅專用發票的壹方憑發票抵扣聯與主管稅務機關聯系，在稅務機關的掃描儀上掃描，計算機讀取票面上的密文，與票面上的七項數據(發票代碼、發票號、發票日期、買方納稅人識別號、賣方納稅人識別號、金額、稅額)進行比對。
比對壹致後，數據將傳輸至中國國家稅務總局增值稅發票比對系統數據庫。這些數據將在那裏等待90天，等待賣方復制納稅申報數據並與之進行比較。如果比較壹致，則通過；不壹致或沒有可比較的對應發票數據對，信息將自動轉移到失敗的數據庫。
稅務稽查人員根據調取的已認證發票上的信息，查找開具和取得發票的當事人，核實原因，做出相應處罰。
認證專用發票是企業項目抵扣的依據。
如果貴公司也進行網上認證，可以隨時在線進行認證；如果沒有，壹般在月底集中到主管稅務機關認證。
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