章丘市國家稅務局設10個內設機構（級別為正股級）、1個直屬機構（級別為副科級）、1個事業單位（級別為正股級）。 1、辦公室
擬訂本單位年度工作計劃、有關工作制度；組織起草和審核縣局重要文稿；負責機關文電、機要、會務、檔案、督辦、信訪、保密、密碼、保衛等工作；承擔面向社會的稅收宣傳及機關政務公開、政府信息公開和新聞發布工作；承辦網站運行和維護工作；組織辦理人大代表議案、建議和政協委員提案的有關事項；管理機關財務和其他行政事務。
2、政策法規科
擬訂並組織實施本單位依法行政、依法治稅工作方案；組織協調涉及多稅種、綜合性稅收政策的落實工作；承擔機關有關規範性文件的合法性審核工作，並定期進行清理、評估和反饋；承辦局外涉及多稅種、綜合性稅收政策文件會辦工作；牽頭重大稅收案件審理及規範稅務行政審批工作；承辦稅收規範性文件的備案備查工作；辦理行政復議、賠償案件及行政訴訟案件；負責組織對稅收法律、法規執行情況進行日常管理性監督檢查；承辦重大稅收案件的審理和行政處罰、聽證工作；負責稅務行政訴訟和行政復議等事項；負責風險管理工作。
3、稅政科
負責流轉稅、所得稅等稅種的稅政業務；管理增值稅專用發票；負責金稅工作流轉稅業務的管理、推廣應用及認證報稅、數據采集、稽核管理工作；負責增值稅等稅種的納稅評估、日常稽核和日常管理性檢查工作；負責稅收協定執行、反避稅實施、外國居民稅收監管、情況交換、國際稅務管理合作等；負責涉稅法律事務；負責對出口企業退免稅申報的審核和確認，組織落實本地出口貨源征稅情況並負責對外復函，負責本地出口貨物專用繳款書及分割單開具的檢查及指導工作；承辦領導交辦的其它工作。
4、收入核算科
牽頭編制年度稅收計劃、出口退（免）稅計劃，分配下達年度內免抵調庫計劃；監督檢查稅款繳、退庫情況；組織開展稅收收入分析預測、稅收能力估算及重點稅源監控、企業稅收資料調查工作；組織實施稅收會計核算、統計核算、票證管理等相關制度；承擔稅收收入數據的綜合管理應用工作，對外發布稅收收入數據。
5、納稅服務科（辦稅服務廳）
組織、協調和指導稅務系統各部門、各稅種、各環節的納稅服務工作；擬訂並組織實施納稅服務工作規範和操作規程；組織實施面向納稅人的稅法宣傳；負責納稅人到稅務機關辦理的各種涉稅事項，具體包括稅務登記、納稅申報、稅款征收、稅款解繳、欠稅公告、發票購銷、稅法宣傳、金稅發售、報稅稽核、咨詢輔導和受理減免申請及有關優惠政策申請等；承擔車輛購置稅的日常管理工作，管理車輛購置稅票證。
納稅服務科與辦稅服務廳合署辦公。
6、征收管理科
組織實施綜合性稅收征管法律法規、部門規章及規範性文件，擬訂具體操作辦法；研究提出專業化征收管理和稅收征管規程完善的建議；組織實施稅收征管數據管理和應用辦法、綜合性納稅評估辦法，承辦征管質量考核工作；承擔稅務登記、納稅申報、普通發票管理、稅控器具推廣應用等工作；組織實施個體和集貿市場稅收征管、稅收管理員制度。
7、人事教育科
研究和執行人事管理制度；負責機構、編制、任免、考核、調配、交流、辭職辭退、工資福利、專業技術職務等人事管理工作;負責離退休幹部及提前離崗人員的管理和服務；負責思想政治工作、精神文明建設和基層建設；負責教育培訓管理工作；負責黨建、工會、***青團和婦聯工作；承辦領導交辦的其它工作。
8、監察室
組織落實紀律檢查、行政監察工作制度，擬訂具體實施辦法；擬訂並組織開展黨風廉政建設、反腐敗工作和糾風工作規劃、年度計劃；受理對本單位工作人員違法違紀行為的檢舉、控告及有關申訴；查處本單位工作人員違反黨紀政紀案件及其他重要案件。
9、稅源管理科
負責對所轄稅源的監控管理工作，對轄區內納稅人實行分類管理和服務。負責所轄納稅戶稅務登記及納稅申報的調查核實、進行稅源預測和分析、重點稅源管理跟蹤監控、稅收宣傳、納稅輔導、稅收調研、納稅服務、日常檢查、戶籍管理、政策送達、稅源調查、定額核定、催報催繳、數據采集分析、組織實施納稅評估、處理壹般性違規違章行為等，承辦領導交辦的其他工作。
設置2個稅源管理科。
機關黨委辦公室 負責機關和直屬單位的黨群工作；承擔機關精神文明建設和機關人員思想政治工作；承擔入黨積極分子的教育培訓考察工作及發展黨員工作；承擔機關統戰工作。 稽查局
組織落實稅務稽查法律法規、部門規章及規範性文件，擬訂具體實施辦法；組織、協調、督辦稅收違法案件的查處；受理稅收違法案件的舉報，辦理重大稅收違法案件的立案和調查的有關事項並提出審理意見；牽頭組織實施稅收專項檢查和稅收專項整治工作；協調公安、檢察、審判機關處理稅務稽查有關工作；指導、協調稅務稽查工作。
稽查局設5個內設機構（級別為副股級）：辦公室、綜合選案科、檢查科、案件審理科、案件執行科。 信息中心
承擔本單位信息化建設的技術服務、技術支持和技術保障工作；承擔稅收管理信息系統的運行維護工作；組織本單位技術基礎設施建設管理與運維；組織本單位信息安全管理與實施。