北京青年報開始全面改版，試圖打破危機。改版後，版面結構調整取得明顯成效，疊放過程方便了讀者定向閱讀。從過去的不重疊到現在的A、B、C、D、E、F六疊，北京青年報以整齊規範的版群出現，即新聞版群、日報副刊、時代專刊系列。在新聞處理上，分類組合，新聞“本地、國內、國際、財經、娛樂、體育”各方面由壹個編輯組主導。版塊的劃分很好地梳理了內容的分布，使報紙結構更加清晰合理。同時濃縮專刊，將過去七個副刊所承擔的深度報道和分析報道的職能全部由新聞版面承擔。由於新聞頁數的限制，過去的長篇報道消失了。改版前，《環球周刊》、《法制周刊》整合為《國際焦點》、《法制圓桌》等單頁，固定專刊的報道形式消失，大大減少了每周固定內容的深度分析報道。
版面的變化是為了突出頭版的導讀功能，將各版組的重要新聞以“新聞”或“摘要”的形式放在頭版。這種“新聞窗口”的方式已經在國內外的報紙上相當流行。《南方都市報》頭版唯壹的功能是導讀，而《經濟觀察報》頭版是導讀加介紹。重要稿件的標題和前兩段放在首頁，大塊內容放在後面。《北京青年報》頭版是新聞加導讀的折中模式，既有帶圖的重要新聞，也有小豆腐塊的導讀。在圖片的使用上，北京青年報加大了力度。除了保留大圖和頭條新聞圖片為主，改版後國內新聞和國際新聞版塊每天專門給壹個圖片版面，將圖片的使用範圍擴大到以前的兩倍。
2012北京青年報新增6期周刊。