1994年9月，淄博市稅務局隨稅制改革機構分設為淄博市國家稅務局與淄博市地方稅務局。9月10日，中***淄博市地方稅務局黨組成立。局機關下設辦公室、政工科、流轉稅管理科、所得稅管理科、地方稅管理科、計劃會計科、征收管理科、裝具票證管理科；9月28日，淄博市地方稅務局稽查分局成立，副縣級建制；10月21日，淄博市地方稅務局直屬征收分局成立，副縣級全額事業單位。
1996年12月，機構改革，經淄博市人民政府批準，淄博市地方稅務局機關設立八個職能科室：辦公室、稅收管理壹科、稅收管理二科、稅收管理三科、征收管理科、計劃財務科、裝備票證管理科、人事教育科。
1997年2月，淄博市地方稅務局涉外征收分局成立。
1998年5月，適應全市財稅體制改革的要求，地方稅務管理體制進行了改革，實行分級管理，保留淄博市地方稅務局直屬征收分局，新設齊魯石化、博山、淄川、周村分局，負責所在區的市屬及部分市屬以上企事業單位的地方稅收。7月，淄博市地方稅務局稽查分局改名為稽查局。9月，山東省人民政府決定，對全省地方稅務機關實行"上級地稅部門與地方政府雙重管理、以上級地稅部門垂直管理為主"的管理體制。市局機關內設辦公室、稅收管理壹科、稅收管理二科、稅收管理三科、征收管理科、計劃財務科、裝備票證科、人事教育科8個職能科室；下轄直屬征收分局、涉外征收分局、齊魯石化分局、博山分局、淄川分局、周村分局、稽查局、集體企業財務管理處、培訓中心、魯中會計師事務所10個直屬單位和張店區局、淄川區局、博山區局、臨淄區局、周村區局、開發區分局、桓臺縣局、沂源縣局、高青縣局9個區縣局。
2001年，淄博市地方稅務局機關內設辦公室、稅收管理壹科、稅收管理二科、稅收管理三科、征收管理科、計劃財務科、票證裝備科、人事教育科8個職能科室；下轄直屬征收分局、齊魯石化分局、稽查局、博山分局、淄川分局、周村分局、涉外分局、集體企業財務管理處、培訓中心9個直屬單位和張店區局、淄川區局、博山區局、臨淄區局、周村區局、開發區分局、桓臺縣局、沂源縣局、高青縣局9個區縣局。
2002年9月，按照山東省地方稅務局機構改革的要求，重新進行了機構設置。市局機關內設辦公室、政策法規科、稅收管理科、征收管理科、計劃統計科、財務裝備科、組織人事科、政治工作科（與機關黨委合署辦公）、監察室9個科室。市局直轄直屬征收分局、齊魯石化分局和涉外分局6個征收分局及1個稽查局；下轄張店、臨淄、淄川、博山、周村、高新區6個區分局和桓臺、沂源、高青3個縣局。
2004年7月，按照山東省機構編制委員會辦公室和山東省地方稅務局的文件精神，市局設立信息中心（掛地稅納稅服務中心牌子）作為事業單位。