1、如果父母選擇由其中壹方按扣除標準的100%扣除的，子女教育扣除比例為100%；
2、如果雙方選擇分別按扣除標準的50%扣除，則子女教育扣除比例為50%。但是具體扣除方式在壹個納稅年度內不能變更。
稅務機關核查專項附加扣除情況時，納稅人任職受雇單位所在地、經常居住地、戶籍所在地的公安派出所、居民委員會或者村民委員會等有關單位和個人應當協助核查。扣繳義務人發現納稅人提供的信息與實際情況不符的，可以要求納稅人修改。納稅人拒絕修改的，扣繳義務人應當報告稅務機關，稅務機關應當及時處理。
納稅人選擇納稅年度內由扣繳義務人辦理專項附加扣除的，按下列規定辦理：
1、納稅人通過遠程辦稅端選擇扣繳義務人並報送專項附加扣除信息的，扣繳義務人根據接收的扣除信息辦理扣除；
2、納稅人通過填寫電子或者紙質《扣除信息表》直接報送扣繳義務人的，扣繳義務人將相關信息導入或者錄入扣繳端軟件，並在次月辦理扣繳申報時提交給主管稅務機關。《扣除信息表》應當壹式兩份，納稅人和扣繳義務人簽字（章）後分別留存備查。
法律依據
《國務院關於印發個人所得稅專項附加扣除暫行辦法的通知》
第五條 納稅人的子女接受全日制學歷教育的相關支出，按照每個子女每月1000元的標準定額扣除。
學歷教育包括義務教育（小學、初中教育）、高中階段教育（普通高中、中等職業、技工教育）、高等教育（大學專科、大學本科、碩士研究生、博士研究生教育）。
年滿3歲至小學入學前處於學前教育階段的子女，按本條第壹款規定執行。