辦公室
負責起草和審核重要文件報告；負責全市地方稅務工作會議和局長辦公會、局務會議的組織工作；負責文秘、信息、檔案、信訪、目標管理、稅法宣傳等工作；負責社會治安綜合治理、保密等工作；負責機關綜合、協調工作。
人事教育科
按幹部管理權限負責區、縣地方稅務局領導班子管理和領導幹部的考察、獎懲、任免工作；負責地方稅務系統思想政治工作和教育培訓工作，負責局機關人事、機構編制、勞動工資工作；負責地稅系統精神文明建設。
機關黨委辦公室
負責局機關黨建黨務工作和群團工作。負責局中心組學習工作；負責機關精神文明建設、機關學習型組織建設、地稅文化建設工作；負責局機關的慰問、***建、扶貧助困等工作。
離退休人員工作科
按管理權限負責離退休人員管理工作。
監察審計科
負責地方稅務系統紀檢、監察、廉政建設和糾正行業不正之風工作 。
計劃財務科
貫徹執行國家稅收計劃、會計、統計工作制度和國家金庫條例；負責稅收計劃編制、信息數據統計、計劃執行情況考核和會計核算；負責稅收票證管理工作；管理經費、財務、裝備、固定資產，審核匯編下屬單位的財務預決算；負責地方稅務系統的服裝制作和發放；負責地方稅務系統信息化建設工作。
法制科
擬定稅收管理工作的規章制度；組織實施對稅收法規、規章執行情況的監督檢查； 負責稅務規範性文件的審查備案工作；負責地方稅務規定實施前的準備工作； 承辦重大稅收案件的審理和行政處罰工作；承辦稅務行政執法過錯責任追究案件的調查；承辦市局減免稅審批領導小組日常工作；辦理稅務行政訴訟和行政復議案件；負責執法證件的管理工作；指導、督促稅收優惠政策的貫徹落實； 協調局內稅政管理工作；負責稅收司法保障體系建設、稅收法制培訓、稅收法律援助、稅法宣傳教育工作； 負責稅收政務調研； 指導稅務學會、協會等社團工作。
征收管理科
負責擬定綜合性地方稅收征管具體辦法；組織實施稅收征收管理的法律、法規和規章，處理執行稅收征管法律、法規和規章中的有關事項；負責地方稅收征管體制改革；負責地方稅務登記、申報工作以及稅收資料和辦稅服務廳的管理；負責地方稅收發票管理工作。
工商稅收科
負責營業稅、資源稅的稅收業務和征收管理；負責城市維護建設稅、印花稅、車船使用稅、筵席稅的政策管理和征收工作；負責地方涉外稅收的有關聯絡工作；負責在市內註冊的“三資企業”和市級投資組建的“三資企業”的地方涉外稅收征管工作；參與起草有關地方稅收、涉外稅收規定，制定具體征稅辦法，處理執行稅法和稅收政策中的有關事項。
基金科
負責地方基金、附加、費的代征工作。
所得稅管理科
負責企業所得稅、個人所得稅的稅收業務和征收管理，管理集體企業、私營企業財務會計制度；負責外商投資企業、外國企業的地方稅收業務和征收管理；參與起草有關地方稅收規定，制訂具體征稅辦法，處理執行稅法和稅收政策中的有關事項。
行為稅收管理科
負責契稅、耕地占用稅的征收管理和以契稅為抓手的房地產稅收“壹體化”管理工作，制定具體的征收管理辦法；參與起草有關稅收地方性法規、規章和政策；對有關稅收法律、法規、規章和在執行中的壹般問題進行解釋和處理；參與農村綜合改革有關稅收政策研究、宣傳及涉及人民來信、來訪、舉報的受理工作。
稽查局
負責組織開展稅收專項檢查工作；直接查處重大偷、騙、抗稅案件和領導機關交辦的其他稅收案件。
第二直屬分局
負責高新技術產業開區所轄企業、個體工商戶的稅收、基金、附加費的征收管理工作。
機關服務中心
負責機關物資、物業管理、經營；負責機關的安全、保衛及愛衛工作；管理機關食堂、招待所、門衛；負責職工宿舍的社區管理；負責機關車輛、打字、文印工作；負責機關的接待工作。