1、使用賬號與密碼登錄電子申報系統；
2、點擊“申報繳納”，進入申報畫面；
3、在申報畫面中點擊“個人所得稅明細申報”，進入個人所得稅申報界面；
4、點擊“繳稅”按鈕，進行繳稅；
5、個人所得稅申報完成；
6、也可以選擇前往稅務廳自行繳納。
自然人電子稅務局扣繳端個稅申報的影響因素：
1、納稅人身份：不同身份的納稅人在申報個稅時享受的稅收優惠政策可能不同；
2、收入來源：收入的種類和來源會影響個稅的計算方式和稅率；
3、扣除項目：包括基本扣除、專項扣除、專項附加扣除等，這些扣除項目會直接影響應納稅額；
4、稅率表：根據個人所得稅法規定的稅率表來計算應納稅額；
5、申報時間：申報個稅需要在規定的時間內完成，逾期可能會受到處罰；
6、地區政策：不同地區可能有不同的稅收政策和申報要求。
綜上所述，自然人電子稅務局扣繳端申報個稅的步驟包括登錄電子申報系統，進入申報畫面，點擊個人所得稅明細申報，進行繳稅，最後完成個人所得稅申報，也可以選擇前往稅務廳自行繳納。
法律依據：
《中華人民***和國個人所得稅法》
第十壹條
居民個人取得綜合所得，按年計算個人所得稅；有扣繳義務人的，由扣繳義務人按月或者按次預扣預繳稅款；需要辦理匯算清繳的，應當在取得所得的次年三月壹日至六月三十日內辦理匯算清繳。預扣預繳辦法由國務院稅務主管部門制定。居民個人向扣繳義務人提供專項附加扣除信息的，扣繳義務人按月預扣預繳稅款時應當按照規定予以扣除，不得拒絕。非居民個人取得工資、薪金所得，勞務報酬所得，稿酬所得和特許權使用費所得，有扣繳義務人的，由扣繳義務人按月或者按次代扣代繳稅款，不辦理匯算清繳。