1、自然人電子稅務局零申報流程如下：
（1）登錄電子稅務局，點擊報表後面的填寫申報表。
（2）進入到增值稅申報表後，報表裏的數據都填寫零，有些地區的增值稅申報表也可以不用填就空著。
（3）增值稅零申報也就是沒有收入，所以報表裏的數據都是零，把報表拉到最下方，對納稅人進行數字簽名，或者輸入納稅人密碼；
（4）輸入密碼之後，檢查日期和報表裏的零數據，核對無誤之後點擊。
2、法律依據：《中華人民***和國稅收征收管理法實施細則》第三十三條
納稅人、扣繳義務人的納稅申報或者代扣代繳、代收代繳稅款報告表的主要內容包括：稅種、稅目，應納稅項目或者應代扣代繳、代收代繳稅款項目，計稅依據，扣除項目及標準，適用稅率或者單位稅額，應退稅項目及稅額、應減免稅項目及稅額，應納稅額或者應代扣代繳、代收代繳稅額，稅款所屬期限、延期繳納稅款、欠稅、滯納金等。
二、電子稅務局註銷企業流程
電子稅務局註銷企業流程有：
1、登錄電子稅務局，點擊左側清稅註銷稅申報及繳納套餐，進入清稅申報界面，點擊註銷預檢，當出現允許容缺辦理字樣時，點擊確定即可在網上辦理註銷。
2、在稅務註銷界面，鼠標向下拉至驗證不通過的界面，監控不通過的原因壹般為未進行當月、當季度、當年度的稅費申報、財務報表報送以及企業所得稅清稅申報等，此時可以選擇明細查看未申報事項、然後點擊當期申報進行申報。
3、在要清算報備案界面，選擇清算結束之日後，需在清算結束之日後15日內做好稅務註銷。
4、在撤回清算備案的前提下，重新做稅務註銷，在註銷預檢時，會出現違規事項，無法進行承諾制容缺辦理，按照提示界面找到違規的文書，選擇打印，打印出來後可在註銷界面正常進行稅務註銷容缺制辦理。在提交申請後，出現涉稅事項受理回執單頁面後，當天前往電子稅務局首頁，點擊要辦稅-事項辦理-涉稅文書查簽即可打印清稅證明。
5、若壹直出現註銷稅務登記受理失敗，可以查看壹下失敗的原因。