商、西周時為鄒侯國地。
春秋時齊景公築鄒之長塗，鄒關（今隘阜口）之東始就平地，故名鄒平。
秦屬臨淄郡。西漢置鄒平縣（治所在今孫鎮）、梁鄒縣（治所在今舊口），屬濟南郡東鄒縣（治所在今花溝），屬千乘郡。
西漢置鄒平縣，治所在今孫家鎮。置梁鄒縣，治所在今韓店鎮舊口村。公元前201年（高帝六年），劉邦封武虎為梁鄒侯，於梁鄒立侯國。置於陵縣，治所在今臨池鎮古城村。置朝陽縣，治所在今碼頭鎮舊延安村東南15裏，史稱魏王城。以上四縣統屬青州部濟南郡。置東鄒縣，治所在今高青縣花溝鄉花溝村，屬青州部千乘郡（治所即今高青縣高城鎮北）。
東漢東鄒縣並入臨濟，鄒平、梁鄒2縣自東漢迄三國魏均屬濟南國。
西晉濟南國改為濟南郡，鄒平縣屬之，梁鄒縣屬樂安國。
南北朝時宋武帝劉裕於梁鄒故城僑立平原郡，又僑立平原縣以屬之。432年（元嘉九年），分青州之地僑立冀州（治所在今歷城縣），平原郡縣隸屬之。孝武時，於故於陵縣地置武強縣（治所在今周村區固玄莊），又於縣內置廣川郡（治所在今長山鎮），屬冀州。南朝劉宋改東朝陽縣為朝陽縣，屬濟南郡；又為臨濟縣（治所在今章丘縣臨濟鎮），屬樂安郡。469年（北魏皇興三年）改平原郡為東平原郡，屬齊州（治所在今歷城）；又置平原縣（治所在今好生鎮平原莊），隸東平原郡。 556年（北齊天保七年），移平原縣治入東平原郡城（舊口），東平原郡、清河郡（治所在今淄川）與廣川郡合並，稱東平原郡（治所長山），平原縣、武強縣隸之。
隋開皇三年（583年），移北齊平原縣治於漢鄒平故城孫家鎮，仍為平原縣。586年（開皇六年）置朝陽縣於菅城596年（開皇十六年），改為臨濟縣（治所在今章丘臨濟鎮）。開皇初廢東平原郡，596年（開皇十六年）於北魏平原縣治（今平原莊）置濟南縣。598年（開皇十八年），改平原縣為鄒平縣，復漢舊名，屬齊郡；改武強縣為長山縣（治所在今長山鎮）。大業初，並濟南縣入長山縣，隸淄州（治所在今淄川縣）。606年（大業二年），又省朝陽縣入濟縣，屬齊郡。
唐618年（武德元年），以臨濟縣治置鄒州。鄒平縣、長山縣、臨濟縣均隸之。619年（武德二年），移鄒平縣治於趙臺城（在今九戶鎮古王臺）。625年（武德八年），鄒州廢，又移鄒平縣治復入鄒平故城孫家鎮。鄒平縣、臨濟縣改屬譚州（治所在今章丘縣西平陵城），長山縣改屬淄州。627年（貞觀元年）譚州廢，鄒平縣改隸淄州，臨濟縣改屬齊州。707年（景龍元年），析高苑縣地於漢梁鄒廢城（舊口）置濟陽縣，隸淄州。820年（元和十五年），濟陽縣省入高苑。
北宋鄒平、長山2縣仍屬淄州。景德二年（1005年）鄒平縣治徙至今鄒平縣城。金屬山東東路淄州。元憲宗三年（1253年）析鄒平、章丘各壹部置齊東縣，與鄒平縣、長山縣同屬濟南路，中統五年（1264年）長山改屬般陽路，至元2年（1265年）齊東縣改屬河間路。
明初鄒平縣、齊東縣屬濟南府，洪武二年（1369年）長山縣改屬濟南府。
清代1892年（光緒十八年），黃河河道南移，齊東縣城陷於河中。1894年（光緒二十年）遷縣治於九戶鎮。
民國1913年2月，廢府州，沿用道制。鄒平縣、長山縣、齊東縣隸岱北道。1914年6月3日，袁世凱公布各省道區域名稱，鄒平縣、長山縣、齊東縣均隸濟南道（駐歷城）。1927年廢道制，存省、縣兩級，三縣同直屬省。1936年省下設行政督察專員公署，全省劃為12個行政督察區。鄒平縣、長山縣屬第五行政督察專員公署。因蘆溝橋事變爆發，僅設7個專員公署，余未及設立，齊東縣直隸於省。1938年至1942年間，沈鴻烈任國民黨山東省主席，劃全省為17個行政督察區，先後成立行政督察專員公署。鄒平縣、長山縣屬第十行政督察區，齊東縣屬第十二行政督察區。 抗日戰爭爆發後，山東抗日武裝力量不斷壯大，抗日根據地日益擴展，各地民主政權相繼建立，1941年，中國***產黨山東省戰時工作推行委員會（1940年8月1日成立）將全省劃為六個行政區。根據抗日鬥爭形勢需要，將鄒平縣、長山縣劃為北鄒長、南鄒長臨時政區，與齊東縣同屬清河區。1943年9月，山東省戰時工作推行委員會改為山東省戰時行政委員會，領五個行政主任公署和壹個直屬專員公署、18個專署區、北鄒長改為鄒平縣，南鄒長改為耀南縣，同屬清河行政區清西專署區。1944年初，冀魯邊區與清河區合並，成立渤海區行政公署。鄒平縣、耀南縣、齊東縣屬之。1945年（民國34年），何思源任國民黨山東省主席。全省設6個政府辦事處，17個行政督察區。鄒平縣、長山縣隸第壹辦事處（魯北辦事處）第十行政督察區，齊東縣隸第五辦事處（魯中辦事處）第十二行政督察區。1945年8月13日，中國***產黨領導的山東省政府成立，黎玉為主席。在全省設5個行政公署，21個專員公署。鄒平縣、耀南縣隸渤海行署第六專署，齊東縣隸渤海行署第二專署。1945年至1946年上半年，渤海行署所轄6個專署調整為4個專署。鄒平縣、耀南縣、齊東縣隸渤海行署第三專署（又稱清河專區）。1947年（國民36年）3～8月間，國民黨山東省主席王耀武撤銷6個政府辦事處及第九、第十二兩個行政督察區，鄒平縣、長山縣、齊東縣屬第十行政督察區。
1948年9月24日濟南解放。國民黨山東省政府行政建制遂廢。1949年3月，山東省政府更名為山東省人民政府。鄒平縣、耀南縣、齊東縣屬渤海行署清河專區（行署駐今惠民縣城）。
1950年5月清河專區撤銷， 齊東縣改屬惠民專區，耀南縣復名長山縣，與鄒平縣同屬淄博專區。 同年11月析長山縣周村鎮與張店合置張周市，屬淄博專區。1953年7月鄒平、長山2縣劃歸惠民專區。1956年3月撤銷長山縣，並入鄒平縣；撤銷高青縣，並入齊東縣；隸屬均不變。1958年12月撤銷齊東縣，所轄之九戶、青城、黑裏寨、花溝、 魏橋、碼頭等6處人民公社並入鄒平縣，其余並入博興縣。與此同時鄒平縣轉屬惠民專區與淄博市合並設置的淄博專區。 1961年6月淄博專區撤銷轉屬、復置的惠民專區。 同年10月青城、花溝、黑裏寨3個區劃歸復置的高青縣。1967年惠民專區改稱惠民地區，1992年3月更名濱州地區，2000年6月濱州地區撤銷，改置地級濱州市，鄒平縣均屬之。