補發工資的個稅申報應當向主管稅務機關提供書面說明，情況屬實的，可將補發工資分攤與所屬月份工資薪金所得合並計算繳納個人所得稅。所以如果單位補發工資，應當向主管稅務機關提供書面說明，情況屬實的，可將補發工資分攤與所屬月份工資薪金所得合並計算繳納個人所得稅。但是各地的政策可能有所不同，以當地政策為準。《中華人民***和國個人所得稅法》第十二條納稅人取得經營所得，按年計算個人所得稅，由納稅人在月度或者季度終了後十五日內向稅務機關報送納稅申報表，並預繳稅款；在取得所得的次年三月三十壹日前辦理匯算清繳。納稅人取得利息、股息、紅利所得，財產租賃所得，財產轉讓所得和偶然所得，按月或者按次計算個人所得稅，有扣繳義務人的，由扣繳義務人按月或者按次代扣代繳稅款。
法律客觀：壹、補償金個稅怎麽計算經濟補償金個人所得稅={(經濟補償金總收入-當地上年職工平均工資的3倍-實際繳納的社會保險費和住房公積金)/本單位的工作年限-個人所得稅扣除額5000元×適用稅率-速算扣除額}×本單位的實際工作年限級數。二、補償金個稅計算的相關規定1、財政部、國家稅務總局《關於個人與用人單位解除取得的壹次性補償收入征免問題的通知》(財稅2001157號)第1條規定：個人因與用人單位解除勞動關系而取得的壹次性補償收入(包括用人單位發放的、生活補助費和其他補助費用)，其收入在當地上年職工平均工資3倍數額以內的部分，免征個人所得稅;超過的部分按照《國家稅務總局關於個人因解除勞動合同取得經濟補償金征收個人所得稅問題的通知》(國稅發1999178號)的有關規定，計算征收個人所得稅。第2條規定：個人領取壹次性補償收入時按照國家和地方政府規定的比例實際繳納的住房公積金、醫療保險費、基本費、失業保險費，可以在計征其壹次性補償收入的個人所得稅時予以扣除。2、國家稅務總局《關於個人因解除勞動合同取得經濟補償金征收個人所得稅問題的通知》第2條規定：考慮到個人取得的壹次性經濟補償收入數額較大，而且被解聘的人員可能在壹段時間內沒有固定收入，因此，對於個人取得的壹次性經濟補償收入，可視為壹次取得數月的工資、薪金收入，允許在壹定期限內進行平均。具體平均辦法為：以個人取得的壹次性經濟補償收入，除以個人在本企業的工作年限數，以其商數作為個人的月工資、薪金收入，按照稅法規定計算繳納個人所得稅。個人在本企業的工作年限數按實際工作年限數計算，超過12年的按12計算。因為補償金不同於月工資的計算，它的計算是比較特殊的，要考慮計算標準、計算年限以及計算基數的問題，補償金也是要收個人所得稅的，所以在關註個人所得稅的同時，我們也可以多關註壹下補償金的個稅計算。