由於小規模納稅人采用簡易計稅方法，應繳納的增值稅稅額為不含稅銷售額與適用征收率的乘積，不存在進項稅額抵扣。從稅額計算來看，小規模納稅人只有銷項發票，有無進項成本發票對相應稅額沒有影響。但考慮到交易性質和小規模納稅人可以享受的壹些優惠政策，部分企業可能通過小規模納稅人虛構業務降低稅收成本，即通過小規模納稅人虛構交易，小規模納稅人為其虛開發票，名義采購企業取得發票，作為成本在稅前扣除，達到偷稅目的。小規模納稅人可以利用增值稅和企業所得稅的優惠政策控制稅收成本。在這種情況下，小規模納稅人企業實際上是為購買方企業服務的，目的是通過虛構業務偷稅漏稅。
由於小規模納稅人在小型微利企業增值稅、企業所得稅方面享受的稅收優惠更大，小規模納稅人在只開發票而沒有成本票的情況下，如果購銷數據不符，就會被稅務系統警告，進而涉嫌虛開發票。
如果小規模納稅人交易真實，不存在虛開，且由於上遊供應商的原因，如供應商多為個人，壹般風險較低，但由於沒有成本票，企業所得稅無法稅前扣除，會面臨多繳納企業所得稅的風險。
對於企業來說，即使所有的業務都是真實的，對外銷售的收入開發票是真實的，對外采購沒有拿到成本票也是真實的。還是要分析同行業成本發票取得是否困難，同行業增值稅和企業所得稅的稅率是多少，來衡量企業的稅收風險。如果同行業企業獲取成本票沒有困難，只是因為企業的特殊原因，比如貪便宜、選擇供應商等，就要有計劃地糾正這些問題，否則如果被供應商拖累，仍可能面臨較高的稅務風險。
同時需要註意的是，小規模納稅人如果只是開發票，沒有拿到成本票，是不能在企業所得稅前扣除相關成本的。最終匯算清繳加稅後，應納稅所得額虛增，企業需要繳納更多的企業所得稅。多交企業所得稅可以分為三種情況。壹是由於虛增應納稅所得額，企業已不能滿足小型微利企業(資產不超過5000萬，從業人員不超過300人，應納稅所得額不超過300萬)的要求，不能再享受小微企業優惠政策。對於企業來說，多繳稅是雙重的；第二種情況，雖然仍符合小微企業條件，但由於應納稅所得額較高，可以享受2.5%的稅率，現在部分需要按5%繳納企業所得稅；第三種情況是原企業不屬於小微企業，所以納稅額只是未取得成本票的成本乘以25%的稅率。