存量留抵稅額的計算公式是存量留抵稅額=存量留抵稅額×進項構成比例×60%。開始試點當月月初，企業應按不得從應稅服務的銷項稅額中抵扣的增值稅留抵稅額,記應交稅費，增值稅留抵稅額科目，記應交稅費，應交增值稅進項稅額轉出科目。待以後期間允許抵扣時，按允許抵扣的金額記應交稅費，應交增值稅科目，貸記應交稅費，增值稅留抵稅額科目。
二、分析
留抵退稅就是對現在還不能抵扣、留著將來才能抵扣的進項增值稅，予以提前全額退還。所謂的留抵稅額，簡單可理解為當進項稅額大於銷項稅額時，即出現了留抵稅額。進項稅指的是納稅人在購進貨物、無形資產或者不動產等時候支付的增值稅額。而銷項稅，則指銷售時收取的增值稅額。形成留抵稅額的原因有很多，比如集中投資、貨物生產周期較長等。
三、_留抵退稅的辦理流程是什麽
1、登錄電子稅務局，點擊我要辦稅壹般退稅管理； 2、點擊增值稅期末留抵稅額退稅； 3、進入增值稅期末留抵稅額退稅頁面，填寫相應信息，點擊下壹步； 4、查看系統回執單，等待稅務機關審批結果； 5、進入辦稅進度及結果信息查詢，選擇事項進度管理功能，顯示該事項信息，可對該項信息進行查看、修改、刪除、撤銷、辦理進度等操作。或通過返回電子稅務局首頁，服務提醒模塊查詢受理情況；
6、選擇涉稅文書查簽功能，查看相關文書。