國稅局稽查局是同級國稅局的直屬機構，屬於國稅局管轄。
稽查局更側重稅收業務，特別是財會、稅收業務，而國稅局更側重於管理。從鍛煉人的角度，稽查局更好些，從個人今後晉升、發展上，國稅局可能更好些。各有利弊，各有千秋吧。
國稅局稽查局：
稽查局是國家稅務總局主管稅務稽查工作的職能部門。主要職責是：起草稅務稽查法律法規草案、部門規章及規範性文件；辦理重大稅收案件的立案和調查的有關事項並提出處理意見；指導、協調稅務系統的稽查工作。
國稅局：
國家稅務局實行中央、省、市縣的垂直領導體制。1994年實行分稅制改革時，將原來的稅務局分設為國家稅務局和地方稅務局。民間有要求將國家稅務局與地方稅務局合並的呼聲。
國家稅務局主要負責征收中央稅以及中央與地方***享稅等稅收，地方稅務局主要負責征收地方稅等(詳細分工略)。
擴展資料:
國稅局稽查局職責：
1、起草稅務稽查法律法規草案、部門規章及規範性文件；組織擬訂並完善稅務稽查工作規程及選案、檢查、審理、執行各環節相關業務規定；對稅務稽查法律法規、部門規章及規範性文件在執行中的壹般性問題進行解釋；
2、協同立法、公安、檢察和審判機關及其他有關部門解決稅務稽查和涉稅刑事案件的法律適用和司法解釋問題。
3、組織、協調、督辦稅收違法案件的查處。
4、參與重大稅收違法案件的審理工作；組織實施處罰聽證。
5、擬訂並組織實施全國稅收專項檢查工作計劃，牽頭組織全國或地區性稅收專項整治工作。
6、協調稅務稽查中的司法工作；參與稅務治安的協調工作。
7、受理稅收違法案件的舉報，辦理重大稅收違法案件的立案和調查的有關事項並提出審理意見。
8、組織稅收違法案件中增值稅專用發票及其他可抵扣憑證的協查工作；參與協查信息管理系統建設。
9、參與稽查專項經費的管理工作。
10、辦理總局領導交辦的其他事項。
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