土地增值稅清算條件有兩種，壹是主動清算條件，二是被動清算條件。
壹、主動清算條件及時間
納稅人符合下列條件之壹的，應進行土地增值稅清算：
1、房地產開發項目全部竣工、完成銷售;(是指開發項目已經行政管理機關驗收取得初始產權證或驗收證明，開發的項目已經全部銷售完畢;)
2、整體轉讓未竣工決算房地產開發項目;(是指整體將開發的未完工項目轉讓銷售;)
3、直接轉讓土地使用權。(是指納稅人將依法取得的土地使用權轉讓。)
綜上可知，房地產開發企業所開發項目只要符合上述任何壹種條件，就應主動按照規定時間進行土地增值稅清算。而符合主動清算條件規定的納稅人，須在符合清算條件之日起90日內對項目進行清算，攜帶清算資料到主管稅務機關申請辦理清算手續;稅務部門受理窗口按規定對報送資料進行核對，做出是否受理決定;對受理的清算項目應在壹定期限內及時組織清算審核。
二、被動清算條件及時間
被動清算條件是指雖未達到主動清算條件，但是稅務機關要求進行清算的情況。國稅發〔2009〕91號文規定：符合下列條件之壹的，主管稅務機關可要求納稅人進行土地增值稅清算：
1、已竣工驗收的房地產開發項目，已轉讓的房地產建築面積占整個項目可售建築面積的比例在85%以上，或該比例雖未超過85%，但剩余的可售建築面積已經出租或自用;
2、取得銷售(預售)許可證滿三年仍未銷售完畢;
3、納稅人申請註銷稅務登記但未辦理土地增值稅清算手續;
4、省(自治區、直轄市、計劃單列市)稅務機關規定的其他情況。
符合被動清算條件規定的納稅人，由稅務機關確定是否進行清算;對於確定需要清算的，由主管稅務機關下達《土地增值稅清算通知書》，納稅人應當在收到清算通知之日起90日內辦理清算手續。在此環節中，企業需註意的是，國稅發〔2009〕91號對納稅人申請註銷稅務登記進行土地增值稅清算，明確了時限要求。即申請註銷稅務登記前，必須完成土地增值稅清算工作，否則不予辦理稅務註銷、工商註銷。